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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003433`

染色体: Chr02 坐标: 55565258-55566896 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003433`
名称	SmilChr02G003433
描述	probable galacturonosyltransferase-like 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55565258 - 55566896 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010412`
GeneID	`131010412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010412`
原始查询	`SmilChr02G003433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galacturonosyltransferase-like 1
产物	probable galacturonosyltransferase-like 1
Arabidopsis	`AT1G19300` (PARVUS) Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838512] identity=78.3; qcov=0.924; evalue=2.08e-180; confidence=high
Rice	`Os03g0678800` - identity=66.9; qcov=0.927; evalue=5.51e-153; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057793906.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793906.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793906.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793906.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55565584`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	116	A1,A13,A14,A16,A20,A23,A25,A4,A5,B100,B102,B106,B108,B111,B112,B117,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B140,B15,B2,B20,B23,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B37,B40,B42,B43,B46,B48,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B62,B66,B67,B68,B70,B71,B73,B74,B75,B79,B80,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B95,B98,C15,C16,C18,C19,C2,C22,C26,C27,C3,C32,C33,C35,C36,C37,C39,C40,C43,C44,C48,C5,C51,C52,C53,C59,C6,C60,C61,C65,C67,C68,C70,C71,C72,C76,C78,C79,C81,C83,C86,C87,D11,D3,D4,D5,D9
`Chr2:55565592`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	78	A1,A14,A16,A20,A23,A25,A4,A5,B100,B102,B111,B117,B125,B126,B13,B130,B15,B2,B20,B23,B28,B29,B30,B37,B42,B43,B48,B50,B51,B53,B54,B57,B59,B6,B66,B67,B70,B73,B74,B75,B88,B91,B93,B94,B98,C15,C16,C18,C2,C22,C24,C26,C27,C32,C35,C37,C4,C40,C43,C44,C48,C5,C6,C60,C61,C67,C68,C70,C71,C72,C78,C81,C83,C86,D11,D3,D4,D5
`Chr2:55565647`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr2:55565647`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr2:55565715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:55565826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:55565860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:55565988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:55566063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B40,C16,C61
`Chr2:55566075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C71
`Chr2:55566087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:55566089`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793906.1

355 aa

178

355

Glyco_transf_8

PF01501 Glyco_transf_8 68-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793906.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	68	326	1.5e-47	163.0	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937923.1
CAAAAGCACAGGAAGTTTCATTTCATAAAATGTATAAGATCTAAAATGAGTATGAAACAAATAAATTCCATTTGAAAATCTTTGACTCGGCCCGGCCAGCGATCCAGCTACGCATAACCCTTACCCCACCACCTTACACCTGCATTTTTTGTTTCATTTCAATTTTCAAATCCCAAAAGCGTGTCCTTTTCTTTTAACTCCAAATGTCCTTTTATTTTTACTTGAAACTCAATCCAATTCCATTTCCCCCCTATCCTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010412
ATGACACCACCACCTCTCTTCTCTCTTTCTCTTTCTCTATCTCTCCTAATTTTCTCGCTCTTGCCCACTTCTTCAGCTGACCAAAATGTTACAGCCTCAATCTCACAGCAATTTAGAGAGGCCCCCCAATTCTACAACGCCGCCGCCTGCCCTTCAATCCTGGGTGGCGCCAGGCAATTCATTTGCTCGAGCGACGCCGTCCACGTCGCAATGACGCTGGACGCGGCCTACATTCGGGGCTCCATGGCGGCGATCCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793906.1
MTPPPLFSLSLSLSLLIFSLLPTSSADQNVTASISQQFREAPQFYNAAACPSILGGARQFICSSDAVHVAMTLDAAYIRGSMAAILSILQHTSCPQNVFFHFVASASADASLLGSTIGASFPYLSFRIYHFRDSAMAGLISTSIRSALDCPLNYARSYLADLLPPCVRRVVYLDSDLVLVDDIAKLAAIPLGGGRVLAAPEYCNANFTSYFTPTFWSNPSLSLTFANRKACYFNTGVMVIDLERWRGGGYTMKIEEWMEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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