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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003436`

染色体: Chr02 坐标: 55589245-55596615 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003436`
名称	SmilChr02G003436
描述	protein DA1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55589245 - 55596615 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010410`
GeneID	`131010410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010410`
原始查询	`SmilChr02G003436`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DA1-like
产物	protein DA1-like
Arabidopsis	`AT1G19270` (DA1) DA1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838510] identity=65.6; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0182500` - identity=69.1; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00412 (LIM); PF12315 (DA1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793903.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793902.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793902.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793902.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793902.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55589793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B69
`Chr2:55590085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:55591756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr2:55592830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:55593598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B140,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793902.1

500 aa

250

500

LIM

DA1-like

PF00412 LIM 145-199 aa PF12315 DA1-like 294-494 aa

XP_057793903.1

463 aa

232

463

LIM

DA1-like

PF00412 LIM 108-162 aa PF12315 DA1-like 257-457 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793902.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	145	199	2.2e-09	38.1	LIM domain
`XP_057793902.1`	Pfam	`PF12315`	DA1-like	Family	294	494	4.9e-94	314.4	Protein DA1
`XP_057793903.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	108	162	1.9e-09	38.4	LIM domain
`XP_057793903.1`	Pfam	`PF12315`	DA1-like	Family	257	457	4.5e-94	314.5	Protein DA1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937920.1
CAACCATTCCAACTGCGTTTGATATTTCTTAGTCAAACGTTGTTTTTGGGGTTTTAATTTAGCCTATTTTAGTCAGAACATTTTCGTCCATTTTGACTTCAAAAATCATGGAACAATTCTTTCATGTGATCACACTATTTAATAATTTTCCCCAAAGATTTTGTTTTTTGTATCTTGGTGGGCTGCCCGAACAATAGAAATTTCTGGGCATTCATCATTTTGTTCAGCAATTTTGTTGAAAACTCAACGTATTGCCGGAG...

XM_057937919.1
AACCATTCCAACTGCGTTTGATATTTCTTAGTCAAACGTTGTTTTTGGGGTTTTAATTTAGCCTATTTTAGTCAGAACATTTTCGTCCATTTTGACTTCAAAAATCATGGAACAATTCTTTCATGTGATCACACTATTTAATAATTTTCCCCAAAGATTTTGTTTTTTGTATCTTGGTGGGCTGCCCGAACAATAGAAATTTCTGGGCATTCATCATTTTGTTCAGCAATTTTGTTGAAAACTCAACGTATTGCCGGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010410
ATGGGCTGGTTTAGCAAAATTTTCAAAGGTTCAGAGCATAAAGTTTCAGAGGGGCAGTGTGATTGGAGATATGGAGCTGAACCAGTGGATAATAATCCATCTACTTCATGGGACTCATGGTCAGAGATGGAAGACATAGACCGTGCAATTGCTTTATCGCTTTCAGAAGAAGATCAAAGAGGAACTACTATCATTGATAGTGAACCGCAATTGGAAGAAGATGAACTACTTGCTAGGGCTATCCAGGAGAGCTTGAATGT...

LOC131010410
ATGGGACTCATGGTCAGAGATGGAAGACATAGACCGTGCAATTGCTTTATCGCTTTCAGAAGAAGATCAAAGAGGAACTACTATCATTGTGAACCGCAATTGGAAGAAGATGAACTACTTGCTAGGGCTATCCAGGAGAGCTTGAATGTCGAGTCTCCAGCACAGCCAGGGACCCCAAATGACAATGGCATGGGAAATGGATATGGACATGGAAGTGGGTACGGGCAAGGACATGGACATGGAAATGGACATGGAAGTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793902.1
MGWFSKIFKGSEHKVSEGQCDWRYGAEPVDNNPSTSWDSWSEMEDIDRAIALSLSEEDQRGTTIIDSEPQLEEDELLARAIQESLNVESPAQPGTPNDNGMGNGYGHGSGYGQGHGHGNGHGSGHGNDSLYQPISFPYSISLRICAGCNTEIGHGRFLSCMSAVWHPECFRCNGCSQPISDYEFSMSGSYPYHKACYKESYHPKCDICNHFIPTNATGLIEYRAHPFWSQKYCPSHELDGTTRCCSCERMESWDAKFAPL...

XP_057793903.1
MGLMVRDGRHRPCNCFIAFRRRSKRNYYHCEPQLEEDELLARAIQESLNVESPAQPGTPNDNGMGNGYGHGSGYGQGHGHGNGHGSGHGNDSLYQPISFPYSISLRICAGCNTEIGHGRFLSCMSAVWHPECFRCNGCSQPISDYEFSMSGSYPYHKACYKESYHPKCDICNHFIPTNATGLIEYRAHPFWSQKYCPSHELDGTTRCCSCERMESWDAKFAPLNDGRKLCLECLDSAIMDTDECQPLFLDILEFYEGLNM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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