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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003442`

染色体: Chr02 坐标: 55696078-55699593 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003442`
名称	SmilChr02G003442
描述	uncharacterized SmilChr02G003442
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55696078 - 55699593 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010418`
GeneID	`131010418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010418`
原始查询	`SmilChr02G003442`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=34.1; qcov=1.03; evalue=1.03e-36; confidence=low
Rice	`Os03g0643050` - identity=42.1; qcov=0.995; evalue=1.15e-51; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793914.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057793914.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057793914.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793914.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793914.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55696814`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B1,B102
`Chr2:55696814`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B1,B102
`Chr2:55696826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:55696831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:55696846`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	65	A21,A7,A9,B1,B105,B106,B114,B118,B119,B123,B133,B134,B137,B138,B14,B140,B16,B17,B19,B20,B25,B28,B29,B30,B33,B36,B41,B47,B58,B65,B66,B70,B72,B73,B81,B9,B90,B92,B99,C10,C11,C19,C2,C20,C21,C37,C38,C42,C51,C52,C54,C56,C65,C67,C69,C72,C73,C75,C76,C84,C9,D10,D6,D8,D9
`Chr2:55696862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B102
`Chr2:55696916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	77	A10,A13,A18,A20,A24,A25,A4,A7,A8,B101,B102,B106,B108,B109,B110,B115,B117,B120,B121,B125,B130,B135,B16,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B30,B37,B4,B45,B46,B49,B50,B52,B57,B60,B62,B74,B75,B77,B85,B86,B91,B99,C10,C11,C12,C23,C28,C31,C33,C35,C39,C40,C42,C45,C46,C5,C50,C52,C53,C58,C65,C69,C7,C75,C76,C80,C81,D10,D3,D9
`Chr2:55696924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D10
`Chr2:55696931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:55696932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A5,B59,C71
`Chr2:55696967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B21,B42,B43,B95,C39
`Chr2:55696967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B42,B43,B95,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793914.1

217 aa

108

217

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

PF13359 DDE_Tnp_4 5-153 aa PF01609 DDE_Tnp_1 9-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793914.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	5	153	2e-22	80.2	DDE superfamily endonuclease
`XP_057793914.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	9	153	3.8e-10	40.6	Transposase DDE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096552.1
TAAATCTCTGTATTACGCTGCATTAATAATCCCTCCAACCCCATCCGATTAATAATCTAGACAATTTATCCCCACATATTTCGATACCCTCGCACGACTTCCGATGACAAACTTTTTGCCCTATCTCTCATCTTCCCCACTCGATTCTCATTCCATCTAATTTCGAAAGGTTTGAACTTCGATTTTGCGATTTCAAACCATCATCTTCCAGCGGTGTTGAAAGGAAAAATGGGAGACAAAATTTCAAATGCATCCTCGGC...

XM_057937931.1
GGGTTGTTTAGGGGCCTTAGATGGCACTTACGTAAGTGTCATGGTTTCTAACGAAGACAAACCCCGGTATAGAACAAGGAAAGGACAAATATCTACAAATGTGCTTGGTGTTTGTGATCGTAATTCGAATTTCAGTTATGTTCTAACCGGATGGGAAGGATCTGCGGCGGACTCTCGCATCTTACGTGATGCAATAAATAGGCCTCATGGCCTGAAGGTCCCAAAGGGGAAATACTATGTGTGTGATAACGGATACGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010418
ATGGTTTCTAACGAAGACAAACCCCGGTATAGAACAAGGAAAGGACAAATATCTACAAATGTGCTTGGTGTTTGTGATCGTAATTCGAATTTCAGTTATGTTCTAACCGGATGGGAAGGATCTGCGGCGGACTCTCGCATCTTACGTGATGCAATAAATAGGCCTCATGGCCTGAAGGTCCCAAAGGGGAAATACTATGTGTGTGATAACGGATACGCGAATAGTGATGGTTTTCTAACTCCTTTCAAAGGTGTTAGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793914.1
MVSNEDKPRYRTRKGQISTNVLGVCDRNSNFSYVLTGWEGSAADSRILRDAINRPHGLKVPKGKYYVCDNGYANSDGFLTPFKGVRYHLKEWEPNHARPQNKEELFNLRHSKARNVIERAFGILKMRWGILRSPSFYPIRVQNRLIMAAFLLNNFVRMEMPIDPIEQQLDATPQDNGGMDIDASNDEFIEVVDCSPQWNAARNALAEAMWLQYLNSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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