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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003444`

染色体: Chr02 坐标: 55711553-55713525 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003444`
名称	SmilChr02G003444
描述	30S ribosomal protein S9, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55711553 - 55713525 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010420`
GeneID	`131010420`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010420`
原始查询	`SmilChr02G003444`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S9, chloroplastic
产物	30S ribosomal protein S9%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G74970` (RPS9) ribosomal protein S9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843836] identity=74.5; qcov=0.872; evalue=1.12e-95; confidence=high
Rice	`Os03g0769100` (WGL2) - identity=71.5; qcov=0.749; evalue=1.45e-81; confidence=high
GO	GO:0000312 (plastid small ribosomal subunit); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005763 (mitochondrial small ribosomal subunit); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00380 (Ribosomal_S9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010420

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793917.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793917.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793917.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793917.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793917.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55711793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:55713103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793917.1

211 aa

106

211

Ribosomal_S9

PF00380 Ribosomal_S9 90-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793917.1`	Pfam	`PF00380`	Ribosomal_S9	Family	90	211	9.6e-43	146.2	Ribosomal protein S9/S16

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937934.1
AGCTCAACGTCTCACGTTAAGGCCTATGGCTAATATTTGAGGGTATATTGGTCAGTTCAAGTAACATTATCTGCATACTACAAACTCCGACTCTTGCCTAACGCCTATCCAAACCACTCCGAAGTGAACCACCACCATCAATGGCGATGGCTACCTCTATTTCTGCTCTTACCTCATCCTTGTCTTCACTCTCTTTCTCCTCCCAAATCTCTCAGAAACCTATCCACTCCCTGTCTTTTCCTTCGCCCAAACCCCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010420
ATGGCGATGGCTACCTCTATTTCTGCTCTTACCTCATCCTTGTCTTCACTCTCTTTCTCCTCCCAAATCTCTCAGAAACCTATCCACTCCCTGTCTTTTCCTTCGCCCAAACCCCTCTCTCTGAAAACCGCCTCCTCCAGATTTCCCGCTCTCGTCGTCGCTGCCTCCTCCGCCGTCGCTGACCCGACCATTGACACGGATGACTTGAAGAAGTTGGTCAAGTCAAGGCTTCCTGGTGGATTTGCGGCCCAGACCATAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793917.1
MAMATSISALTSSLSSLSFSSQISQKPIHSLSFPSPKPLSLKTASSRFPALVVAASSAVADPTIDTDDLKKLVKSRLPGGFAAQTIIGTGRRKCAIARVVLQEGSGKIIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKTPLVTLGYESSYDVFVKAHGGGLSGQAQAICLGVARALLKVSDSHRSPLKQEGLLTRDSRVVERKKAGLRKARKRPQFSKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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