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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003445`

染色体: Chr02 坐标: 55713959-55715990 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003445`
名称	SmilChr02G003445
描述	chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55713959 - 55715990 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010419`
GeneID	`131010419`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010419`
原始查询	`SmilChr02G003445`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic
产物	chaperone protein dnaJ C76%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G23240` (AT5G23240) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832388] identity=53.1; qcov=0.948; evalue=4.59e-150; confidence=high
Rice	`Os04g0675400` (OsDjC45) - identity=49.8; qcov=0.908; evalue=4.78e-126; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF13370 (Fer4_13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010419

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793915.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057793915.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057793915.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057793915.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793915.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55714441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr2:55714441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:55714509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B66,B93
`Chr2:55714611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:55714626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:55715101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B125,B21,B52
`Chr2:55715101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B21,B52
`Chr2:55715239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr2:55715239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:55715411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr2:55715633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B69,D7
`Chr2:55715699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B40,C16,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793915.1

465 aa

232

465

DnaJ

Fer4_13

PF00226 DnaJ 65-125 aa PF13370 Fer4_13 158-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793915.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	65	125	4.9e-13	49.7	DnaJ domain
`XP_057793915.1`	Pfam	`PF13370`	Fer4_13	Domain	158	212	8.4e-13	49.5	4Fe-4S single cluster domain of Ferredoxin I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937932.1
ATTTTCTTTTGACGTGTATATCATTTCAGCGCGACAAATTGTTGCTTTTATTTCTGAAATTTGGTTCAAAATATCTAATAAATATATGCATAAAAATATCTGTAGAGAGGAGTAACAAAATGGAAAAGTGCAAACATTTCCAGCCGAAGACTCAACTTTCTCAAGAGCTCTCAGGTCATCCTCCCCTTCATCTTCATCATCTTTCACACCAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAATGCACGCTTCTACAACTCTTCTTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010419
ATGCACGCTTCTACAACTCTTCTTCTTCATAGCGTTCCTTCTTCATTGATCCCGAACACCGATCCGAAAGCGATAGAGTTAGGAATCGGAAATCTATTCTTCCGGCAGCAGAGGATCATCAATACGAAAAGACAAAGTAAGAATAAGTTATCAGCATGCAGAGATTCGCAAGAGTTGGCGGTGACGGACTTCAATCTGTACGAGCTCCTCGGCATCGACTCCTCCTCCGACACGAGGGCGATAAAGGAGGCATATAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793915.1
MHASTTLLLHSVPSSLIPNTDPKAIELGIGNLFFRQQRIINTKRQSKNKLSACRDSQELAVTDFNLYELLGIDSSSDTRAIKEAYRALQKRCHPDIAGPPGHDMAIVLNEAYALLSDPISRMAYDREVAKVADLQGYTGRPIYSIWSGPESEERAVFVDEVKCVGCLKCALFAQKTFAVESVYGRARVVAQWADPEHKINDAIAACPVDCISFVERSELPALEFVMSKQPRGSVRIGASNTAGVRTADVFDEVHKFQARY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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