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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003465`

染色体: Chr02 坐标: 55940312-55951864 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003465`
名称	SmilChr02G003465
描述	uncharacterized SmilChr02G003465
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55940312 - 55951864 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010440`
GeneID	`131010440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010440`
原始查询	`SmilChr02G003465`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841083]; symbol=AT1G45150; hit=AT1G45150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841083]; symbol=AT1G45150; hit=AT1G45150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G45150` (AT1G45150) alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841083] identity=72.1; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0581300` - identity=68.9; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13320 (GH123_cat)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793945.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793945.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057793945.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793945.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793945.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55941179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B100,C47,C48
`Chr2:55941251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:55941311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:55941791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B140,B95,C14,C17
`Chr2:55941844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B45
`Chr2:55942173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C70
`Chr2:55942173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr2:55942219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B28,B99,C75,D1
`Chr2:55943354`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A23
`Chr2:55943354`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A23
`Chr2:55943414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:55944442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B28,B99,C75,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793945.1

654 aa

327

654

GH123_cat

PF13320 GH123_cat 382-604 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793945.1`	Pfam	`PF13320`	GH123_cat	Domain	382	604	6.4e-16	59.3	Glycoside hydrolase 123, catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937962.1
GGAATTAGCAAGAAGTGGTGCGCCCAGTAATATCTGACTCACACTGCCGCCGGTTAATGCCACGCACCTCCCGTGTTTCATTTCTCTTCATTATATCATAATTATATAAATAATAATAATAATTTCAATCTTAAATTCCTTGATAATTCCTGCAATTTGCATTTACACTTTCGTCTACACGACAATCGCCCAACTCAAAAAAACAATAATTTAATTTTGAGATTTTCATAGTTTTGTGGTTATTTTAATCGGAACTGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010440
ATGGACAGCTCCGGGAGCCATCCGGAGGCAATGGTACCACCAGTTGAGGGTGTAGCAGGAGGTGGAACAGCATATGGATGGAGCGAAAGTGGCATACAAGATCCAAATTTGTTGAGGGGCACCATTGATCCCCTGAAAGTTCATTCATCAGATTTAGTTCATGCCTGGTGCATGCCAAGCACAGCAAATGTTGGCCCACAAGACATGCCTCGTACATTGGAGCCCATATCTCTTTTAGCAGCAAGAAATGAGAGGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793945.1
MDSSGSHPEAMVPPVEGVAGGGTAYGWSESGIQDPNLLRGTIDPLKVHSSDLVHAWCMPSTANVGPQDMPRTLEPISLLAARNERENFQIAIRPKVSWAGSSVAGIVQMQCTDLCSTSGDRLVVGESLKVRRVVPILGVPDALVPLEVPVSQLTLLPGETTAVYVLIDVPEIQPPGQYEGEFIITATRAETPSTAQCLNKAERNQLYQELKCCLDFVEPIDGKPLDEVVERVKCASSSLRKVLEMPSFSDLYLDNGSGDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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