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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003467`

染色体: Chr02 坐标: 55972794-55975525 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003467`
名称	SmilChr02G003467
描述	ricin B-like lectin R40G3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55972794 - 55975525 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010443`
GeneID	`131010443`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010443`
原始查询	`SmilChr02G003467`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ricin B-like lectin R40G3
产物	ricin B-like lectin R40G3
Arabidopsis	`AT2G39050` (EULS3) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818491] identity=59.9; qcov=0.685; evalue=5.35e-64; confidence=high
Rice	`Os07g0684000` (R40G3) - identity=57; qcov=0.671; evalue=1.23e-66; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010443

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793948.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057793948.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057793948.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793948.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55973116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C45
`Chr2:55973122`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr2:55973122`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr2:55973178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr2:55973357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr2:55974628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:55974676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:55974691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B65,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937966.1
GAAGGCAGCAGTATGATTATATTGAGAACTTCATTTTTTGTATGAAGTTCATAAATCCTTAAAAATCGAAGAATGATATTTGGTTGTTATTTTATTTAGGGTGAACCTCTCCGTGTATTATACTAATCAGTAATCCAAATGAAAAGATTAATATGAAGATTGACGTTGAATATAGTATTGACGCGGTTGTCTTAACTCCTAAGTCTTGCTCCCATAAATACCTGACAACAAGTCTTCTCCGATATTCATTGAAACTTTGT...

XM_057937965.1
TTATTTTATTTAGGGTGAACCTCTCCGTGTATTATACTAATCAGTAATCCAAATGAAAAGATTAATATGAAGATTGACGTTGAATATAGTATTGACGCGGTTGTCTTAACTCCTAAGTCTTGCTCCCATAAATACCTGACAACAAGTCTTCTCCGATATTCATTGAAACTTTGTTCATCAAAAATATCCCACCAAACCAAACACGCTGATGGATCGTCGCCACCACCGCCCCGCCGGCGGGCACCACCACCACCCAGCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010443
ATGGATCGTCGCCACCACCGCCCCGCCGGCGGGCACCACCACCACCCAGCCCCTCCAGTCCACCACCACCACCCACCACCCCCACCTGTAGTACACCACCACCCACCACACCACCACCACCCGACTCCCGTAGTTGTGTTTCCGTCGCCACCTGCTCCCGTGGTGGTGGTAGACCACCACCACCACTCTCCGCCGCCAGTCGACATCTTCAGCAGACCCTCCGTCAAGATGTACTGCAAGGCCGATCCTACCTACTCTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793948.1
MDRRHHRPAGGHHHHPAPPVHHHHPPPPPVVHHHPPHHHHPTPVVVFPSPPAPVVVVDHHHHSPPPVDIFSRPSVKMYCKADPTYSLSISHGTVILVRSNPTDPLQHWIKDDKYSMTVRDQEGLPSFALVNKATGQALKHSIGANHPVQLVQYNPNTLDESILWTEKDLGDGYKAVRMVNNIRLNVDALHGERHHGGVHDGSTVVLGEWKKGENQRWRIDYHCK

XP_057793949.1
MDRRHHRPAGGHHHHPAPPVHHHHPPPPPVVHHHPPHHHHPTPVVVFPSPPAPVVVVDHHHHSPPPVDIFSRPSVKMYCKADPTYSLSISHGTVILVRSNPTDPLQHWIKDDKYSMTVRDQEGLPSFALVNKATGQALKHSIGANHPVQLVQYNPNTLDESILWTEKDLGDGYKAVRMVNNIRLNVDALHGERHHGGVHDGSTVVLGEWKKGENQRWRIDYH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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