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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003468`

染色体: Chr02 坐标: 55983096-55985779 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003468`
名称	SmilChr02G003468
描述	protein SICKLE
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55983096 - 55985779 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010444`
GeneID	`131010444`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010444`
原始查询	`SmilChr02G003468`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SICKLE
产物	protein SICKLE
Arabidopsis	`AT4G24500` (SIC) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828552] identity=33.7; qcov=1.08; evalue=1.79e-27; confidence=low
Rice	`Os02g0510300` - identity=38.6; qcov=0.194; evalue=1.35e-07; confidence=weak
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0035196 (miRNA processing); GO:1903730 (GO:1903730)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010444

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793950.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793953.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057793950.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057793950.1`
5	Stress granule	Stress granule	0.20000	`XP_057793950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55984354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,B72
`Chr2:55985007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B69
`Chr2:55985059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B89,C1,C31,C85
`Chr2:55985101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:55985156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:55985443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:55985569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C37
`Chr2:55985603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B107
`Chr2:55985605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937971.1
TTGCGACTTAAAAAAAAGGGTAAGAAGAAGAAGACGACGAAAGCAAAATCCCCAATTCCGAAAAACCAAACCCTAAACTCCTCCCTCCCTCATTCCAATCCGTCAACTTCCTTCAATTCTTTCACAACTCAAGAGACATTAAATTAAACCCCAAAACAGATTCTTTACACCAACCGCCGCGCCGAATTCGCGACTTAACTCGTCGCCGCCAAGGCCTCCCAGCGGCGAGTCATCCTCGCGGCCAACAGCCATCTCCTAGC...

XM_057937968.1
TGCGACTTAAAAAAAAGGGTAAGAAGAAGAAGACGACGAAAGCAAAATCCCCAATTCCGAAAAACCAAACCCTAAACTCCTCCCTCCCTCATTCCAATCCGTCAACTTCCTTCAATTCTTTCACAACTCAAGAGACATTAAATTAAACCCCAAAACAGATTCTTTACACCAACCGCCGCGCCGAATTCGCGACTTAACTCGTCGCCGCCAAGGCCTCCCAGCGGCGAGTCATCCTCGCGGCCAACAGCCATCTCCTAGCC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131010444
ATGGAGGAGTCTCAGAAAAGAAGGGAAAGGCTGAAGGCAATGCGAATTGAAGCTGCTAATACAGCAGTTAATGCCGACACTGATAGTTTATTGGCATCTGGTGGCCTTTCAAACCCTCTTGTTGAAGGAGAAAGCACTTCCATTCCAACTAAATGTTTTTCTCCAAGATTTGATTATTATACTGACCCTATGGCAGCATTCTCTGGAAGTAGGAGAGATAACATCACTCCTCAGGTCTCACACGGACACTTCAACATGCT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057793950.1
MEESQKRRERLKAMRIEAANTAVNADTDSLLASGGLSNPLVEGESTSIPTKCFSPRFDYYTDPMAAFSGSRRDNITPQVSHGHFNMLPRPTHQNMSPGPTYQGMTPNQSYQPPGVNHPDQRIFQAPGANFNQSPLGRPMELAGRPQGNPPHQNMTPGPTYQSMTPNQSYQPPGVNRPDQRIFQVPGAHFNQSPLGQPMELAGRPQGNPPNAWGGPGALNYTSPSNMSRGRHFGNRSFGQEDHPYYGRGRGQNYYSSNHAS...

XP_057793951.1
MEESQKRRERLKAMRIEAANTAVNADTDSLLASGGLSNPLVEGESTSIPTKCFSPRFDYYTDPMAAFSGSRRDNITPQVSHGHFNMLPRPTHQNMSPGPTYQGMTPNQSYQPPGVNHPDQRIFQAPGANFNQSPLGRPMELAGRPQGNPPHQNMTPGPTYQSMTPNQSYQPPGVNRPDQRIFQVPGAHFNQSPLGQPMELAGRPQGNPPNAWGGPGALNYTSPSNMSRGRHFGNRSFGQEDHPYYGRGRGQNYYSSNHAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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