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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003470`

染色体: Chr02 坐标: 56011015-56015624 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003470`
名称	SmilChr02G003470
描述	uncharacterized SmilChr02G003470
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56011015 - 56015624 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009766`
GeneID	`131009766`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009766`
原始查询	`SmilChr02G003470`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA ligase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843852]; symbol=AT1G75150; hit=AT1G75150; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DNA ligase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843852]; symbol=AT1G75150; hit=AT1G75150; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G75150` (AT1G75150) DNA ligase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843852] identity=36.3; qcov=0.76; evalue=4.08e-54; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009766

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793158.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793158.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793158.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793158.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56011267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr2:56011659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B5,C2,C32,C68
`Chr2:56011684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:56011687`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A18,C39
`Chr2:56011687`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A18,C39
`Chr2:56011711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B120,B77,B85
`Chr2:56012319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:56012855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:56012866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:56012897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C82
`Chr2:56013052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:56014190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B40,C16,C61,D11

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937175.1
AGTGTGTGTGGATTGCTGATTATTTCCACCTTTAGGGGCGCCATTCAATTACACTAAAATAGAAGGGGCAAACGACAATTACATAAATCAATACTACTAAACAACTTGAATTTTTCCCGGCTAAAAATTCCAACCATTTGGCGCTTAAAACCCTACCTCCTCCAAATTATCTAATCTTTCCAGATCCCCATTCAATTCACATCTCAATTTCCTTTCGAATTTCAACCACAAACGGAAAATGGACAGCGACGACGATTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009766
ATGGACAGCGACGACGATTATCAGTCGTTATCACCCCCAAAGGAGCTCTCGCCGCAAGTCCAATTTCGGCGGCTGAAGCGCTTGAAGAAATCCGACCAACCCCTAAAGGATCCGTTGTTTGACTTGACTGATGATCCTATTTTGTTTTCCCACGTCGATTTCGCCAAGCTGGAAGCATTAGAGAATGATTCGGAGCCACAATTTGTCGACGAATCAATTTCAACTGAAGATGCAAATTTATCTCCGGAGTCACTGCCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793158.1
MDSDDDYQSLSPPKELSPQVQFRRLKRLKKSDQPLKDPLFDLTDDPILFSHVDFAKLEALENDSEPQFVDESISTEDANLSPESLPQGDGNQVGSEQVFNESDSTGEANLSQESLSQGVGNEIQNGNKMELGIDVEVKRTKRVLEFDDDVVGGSPMREDSENVDPEKKKEIIGAEDLLEEKEEKKKKKKKRIEKSDGGDELQSKSRGSNKRREELPPKTKRREEKERKEYLKELHAESQRLLRETGDASFKPIPVVHKPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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