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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003474`

染色体: Chr02 坐标: 56047805-56048624 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003474`
名称	SmilChr02G003474
描述	transcription repressor OFP8-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56047805 - 56048624 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010450`
GeneID	`131010450`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010450`
原始查询	`SmilChr02G003474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor OFP8-like
产物	transcription repressor OFP8-like
Arabidopsis	`AT5G19650` (OFP8) ovate family protein 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832085] identity=63.6; qcov=0.292; evalue=6.99e-22; confidence=weak
Rice	`Os01g0226700` (OsOFP1) - identity=50; qcov=0.31; evalue=1.76e-17; confidence=low
GO	GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04844 (Ovate)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010450

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793962.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793962.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057793962.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793962.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793962.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56048083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,C29,C6
`Chr2:56048224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:56048258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:56048304`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B59
`Chr2:56048304`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B59
`Chr2:56048316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:56048453`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr2:56048453`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B36
`Chr2:56048496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:56048560`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr2:56048560`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr2:56048563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793962.1

226 aa

113

226

Ovate

PF04844 Ovate 167-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793962.1`	Pfam	`PF04844`	Ovate	Family	167	224	1e-22	80.6	Transcriptional repressor, ovate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937979.1
ATAAATCTGATTCTACCTTGCTCACTTCAATCTTGCCTACTCTGAATCAAATGGCGAAAGCCAAGAGTCCAAAACTCCACTTCTCTCTCCTAACCTCTCTCCAACTCTGTCGTCCCAAAAAGCCTTGTGCAATGATCAAAAGCCCTCTGCAGCCTCATGTCCCTCTCTCTCCTCTCAACTCCAAAACATTCGACATTTCCTTCCCGGGCACCCCCATCCCCATCCCCCCACCCTCCACGCCCTCGTCCTCGAGGGTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010450
ATGGCGAAAGCCAAGAGTCCAAAACTCCACTTCTCTCTCCTAACCTCTCTCCAACTCTGTCGTCCCAAAAAGCCTTGTGCAATGATCAAAAGCCCTCTGCAGCCTCATGTCCCTCTCTCTCCTCTCAACTCCAAAACATTCGACATTTCCTTCCCGGGCACCCCCATCCCCATCCCCCCACCCTCCACGCCCTCGTCCTCGAGGGTCGCCCCACTCCACCCCGAGGACCCAGATTGGAGGGTTCCATCTCCAAGAAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793962.1
MAKAKSPKLHFSLLTSLQLCRPKKPCAMIKSPLQPHVPLSPLNSKTFDISFPGTPIPIPPPSTPSSSRVAPLHPEDPDWRVPSPRNDSKKSHKSSKSCISRTPCSSSGDSNEEEKEAKKHRARRFKRYGSKEWKEGEGCSDERRPMLGRLAPCMVSMEQSFVVVKKSVDPYEDFKKSMSEMIVANHIFEPKELEQLLMSFLSLNSTLHHKIIIQAFTQILKELFCG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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