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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003482`

染色体: Chr02 坐标: 56095078-56095473 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003482`
名称	SmilChr02G003482
描述	E3 ubiquitin-protein ligase Os06g0535400-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56095078 - 56095473 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009769`
GeneID	`131009769`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009769`
原始查询	`SmilChr02G003482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase Os06g0535400-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase Os06g0535400-like
Arabidopsis	`AT3G05200` (ATL6) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819684] identity=52; qcov=0.382; evalue=1.04e-13; confidence=low
Rice	`Os02g0730050` - identity=45.3; qcov=0.573; evalue=1.79e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009769

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057793159.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057793159.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793159.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057793159.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793159.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56095088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B73,C8,C85
`Chr2:56095203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B27,B42,B43,C25
`Chr2:56095242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:56095342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:56095407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793159.1

131 aa

131

zf-RING_11

zf-C3HC4

zf-RING_2

PF17123 zf-RING_11 81-109 aa PF00097 zf-C3HC4 81-122 aa PF13639 zf-RING_2 81-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793159.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	81	109	6.2e-07	29.7	RING-like zinc finger
`XP_057793159.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	81	122	8.9e-05	23.0	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057793159.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	81	123	5.8e-12	46.4	Ring finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937176.1
ATGGTGTCCTCATTGCCTGAGCTGCCTCCCCCTCTCTCCTTCCTCTGCATCATCGGCATCCTCATCGTGTACGCCATGTGCTGCTACCTCATCATCGATTTCATAAGCGAATACCAAGACGACAGCCCCAACGAGGAACACCACTCAGCTGACTACAGCTCCTATTTTCACATATCAGTGGAGGAGCTGCAAGAGATCACTTGCCTCTACCACAACCACAATGCCAAGGGAGCTTCCATCTGCGCCATCTGCTTGGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009769
ATGGTGTCCTCATTGCCTGAGCTGCCTCCCCCTCTCTCCTTCCTCTGCATCATCGGCATCCTCATCGTGTACGCCATGTGCTGCTACCTCATCATCGATTTCATAAGCGAATACCAAGACGACAGCCCCAACGAGGAACACCACTCAGCTGACTACAGCTCCTATTTTCACATATCAGTGGAGGAGCTGCAAGAGATCACTTGCCTCTACCACAACCACAATGCCAAGGGAGCTTCCATCTGCGCCATCTGCTTGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793159.1
MVSSLPELPPPLSFLCIIGILIVYAMCCYLIIDFISEYQDDSPNEEHHSADYSSYFHISVEELQEITCLYHNHNAKGASICAICLENLRHAQVCRVLPACHHHFHAHCIDPWLSIRLTCPTCRAPFRSSRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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