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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003485`

染色体: Chr02 坐标: 56115171-56117165 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003485`
名称	SmilChr02G003485
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 7-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56115171 - 56117165 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010456`
GeneID	`131010456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010456`
原始查询	`SmilChr02G003485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 7-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 7-like
Arabidopsis	`AT2G16230` (AT2G16230) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816120] identity=64.1; qcov=0.954; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0669300` (OSJNBa0039O18.8) - identity=58.7; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057793970.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057793970.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057793970.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793970.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793970.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56115631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:56115668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B61,C30
`Chr2:56115906`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr2:56115906`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr2:56115945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B27,C29,C47,C82
`Chr2:56116047`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A20
`Chr2:56116087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C60,C78
`Chr2:56116199`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A15,B100,C19,C60
`Chr2:56116199`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A15,B100,C19,C60
`Chr2:56116230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:56116314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B125,B21,B52
`Chr2:56116383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B61,B63,B83,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793970.1

455 aa

228

455

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 28-345 aa PF07983 X8 368-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793970.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	28	345	4.2e-75	253.9	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057793970.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	368	439	2e-18	67.5	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937987.1
CAGTATCCTAGAATAGGTTCCAAGAGATGAATGATTAACAAAGAATCTACATCATTCACACATAAATTCACAGATTTCAACACTCTCACGTTCCACTTCTGCAAGCTTTCTCTCTCTCAAAACAAAAACAAAAAAAAAAGAAATCCGTAATGGCAGTCTTGCTGTACTACTCAGTGCTTTTCTTCCTCTCCATCTTCACCTTTGCTCCACTCTCACAATCGCAGTCTTTCCTTGGAGTGAACTACGGCCAAGTCGCCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010456
ATGGCAGTCTTGCTGTACTACTCAGTGCTTTTCTTCCTCTCCATCTTCACCTTTGCTCCACTCTCACAATCGCAGTCTTTCCTTGGAGTGAACTACGGCCAAGTCGCCGACAACCTCCCGCCGCCGGAAGCGACGGCAAAGCTCCTCCAGTCCTCCGCGGCGAAGGTCCGGCTATACGGGTCAGACCCGGCGGCGATCCGGGCCTTCGCCAATACCGGCATCCGCCTCATGATCGGAGCATCCAACTCCGACATTCCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793970.1
MAVLLYYSVLFFLSIFTFAPLSQSQSFLGVNYGQVADNLPPPEATAKLLQSSAXAKVRLYGSDPAAIRAFANTGIRLMIGASNSDIPGMASDPNFAKSWIATNVAPFLPASNIIAINVGNEVMSYNDRNLMAQLLPAMQNLHAALDSAGLAGKIKVSTVHSMAVLGQSDPPSSGSFDPSIADLLKGLLSFNNATASPFAINPYPYFAYRSDPRPETLAFCLFQPNPGRVDSGSKIKYTNMFDAQVDGVRSALDRMGFKGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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