当前解析结果
SmilChr02G003488| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003488 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003488 |
| 描述 | nuclear transport factor 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 56140501 - 56143078 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009770 |
|---|---|
| GeneID | 131009770 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009770 |
| 原始查询 | SmilChr02G003488 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | nuclear transport factor 2-like |
| 产物 | nuclear transport factor 2-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os02g0497700- identity=48.5; qcov=0.713; evalue=1.57e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009770 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793161.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057793161.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057793161.1 |
| 4 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057793161.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793161.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:56140514 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B107,C27,C3,C64 |
Chr2:56140518 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B29,B86 |
Chr2:56140549 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B11 |
Chr2:56140559 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B137,B65,B74,C86 |
Chr2:56140604 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B50,C10 |
Chr2:56140610 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
Chr2:56140665 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B29 |
Chr2:56140712 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B29,B86 |
Chr2:56140721 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B135,B74 |
Chr2:56140742 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr2:56140778 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr2:56140789 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,B135 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。