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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003509`

染色体: Chr02 坐标: 56285217-56286431 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003509`
名称	SmilChr02G003509
描述	uncharacterized SmilChr02G003509
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56285217 - 56286431 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009776`
GeneID	`131009776`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009776`
原始查询	`SmilChr02G003509`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=55.2; qcov=0.385; evalue=3.4e-34; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=46.8; qcov=1.04; evalue=4.13e-120; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009776

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793167.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793167.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793167.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793167.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793167.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56285221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B98,C60,C70,C79
`Chr2:56285259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B87
`Chr2:56285314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B36,C65,C69
`Chr2:56285455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C60
`Chr2:56285494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B56,B96
`Chr2:56285559`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	52	A10,A15,A22,A23,A3,A4,B102,B105,B106,B11,B111,B114,B122,B13,B132,B133,B138,B18,B29,B3,B40,B43,B47,B53,B56,B63,B70,B79,B81,B94,B96,B99,C1,C12,C19,C22,C31,C34,C35,C36,C40,C41,C42,C45,C55,C63,C67,C68,C82,C87,D6,D9
`Chr2:56285571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,B71,B82,C62
`Chr2:56285637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C71
`Chr2:56285650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr2:56285662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B56,B96,C28
`Chr2:56285684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C86
`Chr2:56285685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793167.1

371 aa

186

371

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 137-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793167.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	2.2e-19	69.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057793167.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	304	3.4e-73	246.3	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937184.1
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGACGAAAAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTCGCCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTTCGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009776
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGACGAAAAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTCGCCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTTCGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793167.1
MTVASSYRFDPPPPRPTKKRAVVRRDREGGAERLHRDYFAVEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRSDAVGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTSADCCDEYLRIGESTELECLKKFCKAVVRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNFPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEVAVHFLANNSHHTRGYYLTDGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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