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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003524`

染色体: Chr02 坐标: 56404694-56406219 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003524`
名称	SmilChr02G003524
描述	CBS domain-containing protein CBSX3, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56404694 - 56406219 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010489`
GeneID	`131010489`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010489`
原始查询	`SmilChr02G003524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CBS domain-containing protein CBSX3, mitochondrial-like
产物	CBS domain-containing protein CBSX3%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G47271` (AT1G47271) Cystathionine beta-synthase (CBS) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241044] identity=69.9; qcov=0.819; evalue=2.16e-81; confidence=high
Rice	`Os03g0737000` (OsCBSX4) - identity=57.2; qcov=0.869; evalue=1.07e-68; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00571 (CBS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010489

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057794006.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057794006.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794006.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794006.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794006.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56405234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:56405645`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B139,B21,B23,C1,C22,C4,C55,C80,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794006.1

199 aa

100

199

CBS

PF00571 CBS 66-113 aa PF00571 CBS 125-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794006.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	66	113	3.4e-23	82.4	CBS domain
`XP_057794006.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	125	180	3.4e-23	82.4	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938023.1
GAACAAAACAATTACTTGGACATTTAAATTTTTCATTTCGCCTTGGTAGAAAGACAAAGTTGGCAACAACTTAATCAAGAAAAGAACGCACTAAACTAATCCCAACAAGCAACTGATTAAGGGAATGAAACATTCTAATCCCAACTTGATATAAGGCTAATTAAGCCCTGTGTTGTGAAGTTGAATTTCTGAGCTTCAGGTCTACTAAGAAGTATTAAAGATGCAAGGCCTTGTACGATTTTGCCGTGAACATATACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010489
ATGCAAGGCCTTGTACGATTTTGCCGTGAACATATACACATCAAGAAACAGCATCACTTACTGAACTTGATAAAGCATAGAAAAGGTGCAATGGTTGCAAGATCCTACTCGATGCCATTGCCGGAGAAGGGATTGCACAACACAACGATTGCAGAGGTGCTATCGACCAAAGGGCAAGACAGGATCGGATCCTGGGTCTGGTGTCGAACAGATGACACCGTCTATGATGCTGTCAAGCAAATGGCACAGAACAACATAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794006.1
MQGLVRFCREHIHIKKQHHLLNLIKHRKGAMVARSYSMPLPEKGLHNTTIAEVLSTKGQDRIGSWVWCRTDDTVYDAVKQMAQNNIGSLVVLKPGEEQHIAGILTERDYLRKVIVQDRSSKYTKVGEIMTDKDKLLTVTSDTNILHAMQLMTENQIRHAPVIDGKIVGMISMVDVVRAVVEQQHGEMKRLNEFIRGDYY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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