当前解析结果
SmilChr02G003527| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003527 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003527 |
| 描述 | cycloeucalenol cycloisomerase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 56422249 - 56426658 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131010494 |
|---|---|
| GeneID | 131010494 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010494 |
| 原始查询 | SmilChr02G003527 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cycloeucalenol cycloisomerase-like |
| 产物 | cycloeucalenol cycloisomerase-like |
| Arabidopsis | AT5G50375 (CPI1)cyclopropyl isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835105] identity=80.5; qcov=0.975; evalue=7.58e-169; confidence=high |
| Rice | Os11g0302500- identity=66.3; qcov=0.313; evalue=2.6e-37; confidence=low |
| GO | GO:0047793 (cycloeucalenol cycloisomerase activity) |
| KEGG | smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010494 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057794010.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057794010.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057794010.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057794010.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794010.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:56422850 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr2:56422929 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B35,B46,B54,C27,C28 |
Chr2:56424120 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B104,C75,D9 |
Chr2:56425290 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,B101 |
Chr2:56425520 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。