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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003531`

染色体: Chr02 坐标: 56460525-56465736 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003531`
名称	SmilChr02G003531
描述	protein RER1A-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56460525 - 56465736 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010497`
GeneID	`131010497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010497`
原始查询	`SmilChr02G003531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RER1A-like
产物	protein RER1A-like
Arabidopsis	`AT2G21600` (RER1B) endoplasmatic reticulum retrieval protein 1B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816698] identity=58.7; qcov=0.964; evalue=9.53e-83; confidence=high
Rice	`Os06g0708300` - identity=67.4; qcov=0.893; evalue=5.35e-84; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006621 (protein retention in ER lumen); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum)
KEGG	-
Pfam	PF03248 (Rer1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057794013.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057794013.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057794013.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057794013.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057794013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794013.1

196 aa

196

Rer1

PF03248 Rer1 18-180 aa

XP_057794014.1

196 aa

196

Rer1

PF03248 Rer1 18-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794013.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	18	180	5.8e-70	235.2	Rer1 family
`XP_057794014.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	18	180	5.8e-70	235.2	Rer1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096574.1
TACTACCCGGTGAAATTAATTTACTCGTTACAGACCAAAAATGAAGTAGTGAAAATTTTGCCGTAAAAACAAGTTCGCAAGCCATTTGTTTACTTCGTTGTTACACCATTTCTCCCATAAAGTTGAGTGTGAAGATAATGGAAGATGTTGGGACTGATACTGCTGCTCCAGAGTCACCATTAGCAAAGTGGAGAAATGAATTTTCGAGGAAGTTTCAGTTTTATTTGGATAGGTCCGGTCCCCATATGGCTCGTAGGTGG...

XM_057938030.1
GCCATTTGTTTACTTCGTTGTTACACCATTTCTCCCATAAAGTTGAGGTCGGCTCTCTATGTTTATGCATATTTCTTCTAGAATGTTTATGCCGATTCCCTCTCTGTTACAGTTGTAGTTAATACGGACATATTTTGAAACGAATTGCTGATTACGAGTGTGAAGATAATGGAAGATGTTGGGACTGATACTGCTGCTCCAGAGTCACCATTAGCAAAGTGGAGAAATGAATTTTCGAGGAAGTTTCAGTTTTATTTGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010497
ATGGAAGATGTTGGGACTGATACTGCTGCTCCAGAGTCACCATTAGCAAAGTGGAGAAATGAATTTTCGAGGAAGTTTCAGTTTTATTTGGATAGGTCCGGTCCCCATATGGCTCGTAGGTGGCTTGTTACACTTGCTGCAGCAGCAATATACATCTTGCGTGTTTATTATGCTCAGGGGTTTTATGTCATCTCATATGGCCTGTCAATCTACATCTTGAATTTGTTGATCGGGTTTATGTCACCCAAGGTTGATCCTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794013.1
MEDVGTDTAAPESPLAKWRNEFSRKFQFYLDRSGPHMARRWLVTLAAAAIYILRVYYAQGFYVISYGLSIYILNLLIGFMSPKVDPELEMLDGPSSPTRDSEEFRPFVRRLPEFLFWYAITKACCVAFLLTFFSMFDVPVFWPILFFYWFFLFFLTMKRLITHMIKYRYLPFSLGKQRYTGKRPAQTQSTRGLSKD

XP_057794014.1
MEDVGTDTAAPESPLAKWRNEFSRKFQFYLDRSGPHMARRWLVTLAAAAIYILRVYYAQGFYVISYGLSIYILNLLIGFMSPKVDPELEMLDGPSSPTRDSEEFRPFVRRLPEFLFWYAITKACCVAFLLTFFSMFDVPVFWPILFFYWFFLFFLTMKRLITHMIKYRYLPFSLGKQRYTGKRPAQTQSTRGLSKD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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