当前解析结果
SmilChr02G003539| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003539 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003539 |
| 描述 | 50S ribosomal protein L31, chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 56528536 - 56529231 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131010506 |
|---|---|
| GeneID | 131010506 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010506 |
| 原始查询 | SmilChr02G003539 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 50S ribosomal protein L31, chloroplastic-like |
| 产物 | 50S ribosomal protein L31%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT1G75350 (emb2184)Ribosomal protein L31 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843871] identity=62.9; qcov=1; evalue=9.7e-55; confidence=high |
| Rice | Os01g0633000- identity=53.4; qcov=0.78; evalue=1.53e-31; confidence=medium |
| GO | GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation) |
| KEGG | smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF01197 (Ribosomal_L31) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010506 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057794024.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.40000 | XP_057794024.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057794024.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794024.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794024.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057794024.1PF01197
Ribosomal_L31 40-103 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057794024.1 |
Pfam | PF01197 |
Ribosomal_L31 | Family | 40 | 103 | 2.6e-17 | 63.5 | Ribosomal protein L31 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。