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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003545`

染色体: Chr02 坐标: 56607424-56609345 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003545`
名称	SmilChr02G003545
描述	uncharacterized SmilChr02G003545
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56607424 - 56609345 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010507`
GeneID	`131010507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010507`
原始查询	`SmilChr02G003545`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794025.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057794025.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794025.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794025.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56607490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,C11,C52,C69
`Chr2:56607522`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A3,B140,B24,B33,C48
`Chr2:56607522`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A3,B140,B24,B33,C48
`Chr2:56607537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B104,C70
`Chr2:56607537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C70
`Chr2:56607582`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	53	A14,A20,A5,A7,B105,B123,B127,B13,B133,B134,B136,B14,B15,B16,B25,B28,B3,B35,B38,B39,B40,B53,B59,B60,B64,B73,B79,B81,B97,C13,C14,C16,C17,C2,C21,C26,C30,C32,C39,C43,C44,C47,C50,C59,C61,C68,C7,C74,C84,C87,C9,D3,D7
`Chr2:56607614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C70
`Chr2:56607626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:56607773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:56608104`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B127
`Chr2:56608104`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B127
`Chr2:56608263`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	61	A10,A11,A20,A6,A8,B113,B114,B118,B119,B124,B125,B134,B14,B17,B19,B24,B28,B32,B33,B36,B46,B60,B61,B66,B67,B72,B73,B74,B8,B85,B88,B90,B92,C10,C15,C20,C22,C24,C28,C32,C33,C34,C39,C42,C47,C53,C54,C60,C63,C65,C68,C70,C71,C72,C73,C77,C78,C79,C83,C86,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794025.1

476 aa

238

476

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 46-200 aa PF07734 FBA_1 54-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794025.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	46	200	8.7e-11	42.1	F-box associated beta propeller domain
`XP_057794025.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	54	192	1.2e-13	51.5	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938042.1
TCCCGTGCTCTCATTAGGGAAGTGGCCTTACCATCGCATTAGGGTTCCATTCCCCTTCTTCCAAATCAATCAATTTTTGATCGATGATGAATAATTCTGACGAGAAACGGCTTCTTGTGATACGTAACCGTGGAGAGTTGGGTGCGTATTATATAACTGCTCTTTCTCCGCGAGATTTATCTCTAATTCCTGAAGAAAGTTTCGATCTTCCTTTTTTGAATCCAAAGCAGCGTATTGATTCTAACAGTTGCGGAGGTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010507
ATGATGAATAATTCTGACGAGAAACGGCTTCTTGTGATACGTAACCGTGGAGAGTTGGGTGCGTATTATATAACTGCTCTTTCTCCGCGAGATTTATCTCTAATTCCTGAAGAAAGTTTCGATCTTCCTTTTTTGAATCCAAAGCAGCGTATTGATTCTAACAGTTGCGGAGGTTTGTTGTTTATCAGCAATGGTTATGGCCATATTTATCTTTGCAACCCCACAACTAGAATGGTTCAGATGTTTCCTCCCCGGGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794025.1
MMNNSDEKRLLVIRNRGELGAYYITALSPRDLSLIPEESFDLPFLNPKQRIDSNSCGGLLFISNGYGHIYLCNPTTRMVQMFPPREASPNCITLYLGGGVCYDSKSDDYKILRVCAQLYSNPCLHYTTFDLYSLKKKSWRVIPNPTLPKYLNAKVTCIRDKCYWFNRGFTGVECFDCSEESLSHLALPPKTRGFLYELVKFSDEDMLGFIRYRKRGVSSKSSRHDQYFGIAPGYYYELWVWKEELRAWNMNFKVSLGGGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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