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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003553`

染色体: Chr02 坐标: 56711296-56716784 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003553`
名称	SmilChr02G003553
描述	probable methyltransferase PMT28
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56711296 - 56716784 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010519`
GeneID	`131010519`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010519`
原始查询	`SmilChr02G003553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase PMT28
产物	probable methyltransferase PMT28
Arabidopsis	`AT1G19430` (AT1G19430) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838527] identity=59.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0775200` - identity=48.7; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29); PF08241 (Methyltransf_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010519

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057794056.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794056.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794056.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794056.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56711924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:56713456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B127,B14,B44,C68
`Chr2:56713522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B66,B94
`Chr2:56714615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B115,C24,C48
`Chr2:56714829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:56715003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B123,B66
`Chr2:56715042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B13,C2,C32,C68
`Chr2:56715834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B73,B95,C26,C87,D5
`Chr2:56715864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:56716274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:56716293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr2:56716441`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A21,A25,B106,B107,B119,B12,B123,B134,B137,B138,B17,B29,B30,B41,B47,B51,B53,B6,B62,B66,B69,B72,B87,B90,B92,B96,B97,C14,C16,C20,C21,C36,C37,C38,C4,C52,C72,C73,C74,C84,D4,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794056.1

721 aa

360

721

Methyltransf_29

Methyltransf_11

PF03141 Methyltransf_29 227-716 aa PF08241 Methyltransf_11 344-440 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794056.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	227	716	3.6e-182	607.2	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
`XP_057794056.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	344	440	2.3e-09	38.5	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096584.1
CATATTAAGTGAAATCTGTCGTTAACTACAACGTAACCCTTAGTAAAGATCACATTTTTGAATCATGGGTTAATTGAAAATTTACCCATTCTTTGGAGGGTTATGTTGGTTTAATGTCAATTTAGTACAAAATTCTGTTTCTGGATCTTCCTTTGCTTCTACTCTTTTACAGTTAAAACTTAAAACTTCGTCATATTGTAATGATTCGACCTCGCTCCCATCATTCCTACTTCAGCTTAGCTGATCTTTCTCTTTACAGT...

XM_057938073.1
AAATTCCATATTAAGTGAAATCTGTCGTTAACTACAACGTAACCCTTAGTAAAGATCACATTTTTGAATCATGGGTTAATTGAAAATTTACCCATTCTTTGGAGGGTTATGTTGGTTTAATGTCAATTTAGTACAAAATTCTGTTTCTGGATCTTCCTTTGCTTCTACTCTTTTACAGTTAAAACTTAAAACTTCGTCATATTGTAATGATTCGACCTCGCTCCCATCATTCCTACTTCAGCTTAGCTGATCTTTCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010519
ATGGCTATAGGAAGATTTGGGCCCCAGGTGAAGCGCTCTAATCAATCATACGGGTTCTTTGTGAAGCTATCTGCAACTGTGGTATTGGGCCTCTGCTTTGTGATTGTATGGTCTGTGTTTTCAAATTATTCTGTGACTTCTCAAAGGCAGACTTTTGATGACATTGCTGAGCCGGTATCTGCTGCATCAAATGGGAAGGTGAGTAATTTCGGAGTTCACTCTGAAAAAATAGTACCCAAAAAGGAAAAAGAAAGTGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794056.1
MAIGRFGPQVKRSNQSYGFFVKLSATVVLGLCFVIVWSVFSNYSVTSQRQTFDDIAEPVSAASNGKVSNFGVHSEKIVPKKEKESGKQRFKSGLGDKDKKINNGSVPLKPEKKPENGGGGNAKLSKKDGENKNQEDEGSEVEEEEEVITEKGDDEGNDGDEDANAIANANDSVEEDANFINAEEFDQESSEEDNGGSRKANRKTSGPVFDPKKRYTWKLCNTRSKHNYIPCIDIESATGRLQSYRHHERSCPRSAVMCLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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