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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003554`

染色体: Chr02 坐标: 56717584-56722546 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003554`
名称	SmilChr02G003554
描述	DUF21 domain-containing protein At1g47330-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56717584 - 56722546 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010521`
GeneID	`131010521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010521`
原始查询	`SmilChr02G003554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF21 domain-containing protein At1g47330-like
产物	DUF21 domain-containing protein At1g47330-like
Arabidopsis	`AT1G47330` (AT1G47330) methyltransferase, putative (DUF21) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841136] identity=65.9; qcov=1.08; evalue=7.37e-177; confidence=high
Rice	`Os03g0125800` (OsCBSDUF3) - identity=60.5; qcov=1.01; evalue=1.62e-148; confidence=high
GO	GO:0010960 (magnesium ion homeostasis); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF00571 (CBS); PF01595 (CNNM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794060.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057794061.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057794061.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794060.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794060.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56718695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:56718843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C33
`Chr2:56718851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C33
`Chr2:56719441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794060.1

433 aa

216

433

CNNM

CBS

PF01595 CNNM 18-188 aa PF00571 CBS 276-308 aa

XP_057794061.1

404 aa

202

404

CNNM

CBS

PF01595 CNNM 18-153 aa PF00571 CBS 247-279 aa

XP_057794062.1

378 aa

189

378

CNNM

CBS

PF01595 CNNM 6-133 aa PF00571 CBS 221-253 aa

XP_057794063.1

350 aa

175

350

CNNM

CBS

PF01595 CNNM 15-105 aa PF00571 CBS 193-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794060.1`	Pfam	`PF01595`	CNNM	Domain	18	188	2e-34	119.5	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
`XP_057794060.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	276	308	1.2e-10	42.2	CBS domain
`XP_057794061.1`	Pfam	`PF01595`	CNNM	Domain	18	153	1.8e-28	100.1	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
`XP_057794061.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	247	279	9.2e-11	42.6	CBS domain
`XP_057794062.1`	Pfam	`PF01595`	CNNM	Domain	6	133	5e-26	92.2	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
`XP_057794062.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	221	253	7.6e-11	42.9	CBS domain
`XP_057794063.1`	Pfam	`PF01595`	CNNM	Domain	15	105	2.4e-18	67.2	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
`XP_057794063.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	193	225	6.8e-11	43.0	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938078.1
ATAAGGCAAGAAGCTCAAGAAAACTCTTTGTAGCGAACACATAAGATTCACCACCAAAAGAGGTTGATTCGATTATTCTTGGGCTCCGAGCACCGACCACCAAATGAGTGCAAAATGCTAACTTTTTCGAGAATAAAAAAAAAATCAGGAATATAAAAGTGAAAGCTGAAAGTCGAGTAGGATGCAGACAGGCATATGAGCACGAAGTGCGAGATTTTGTTGACGAGGCCTATTTTTAGGAAGTGCGTGCCGGAAGATAC...

XM_057938077.1
TAAGGCAAGAAGCTCAAGAAAACTCTTTGTAGCGAACACATAAGATTCACCACCAAAAGAGGTTGATTCGATTATTCTTGGGCTCCGAGCACCGACCACCAAATGAGTGCAAAATGCTAACTTTTTCGAGAATAAAAAAAAAATCAGGAATATAAAAGTGAAAGCTGAAAGTCGAGTAGGATGCAGACAGGCATATGAGCACGAAGTGCGAGATTTTGTTGACGAGGCCTATTTTTAGGAAGTGCGTGCCGGAAGATACA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131010521
ATGGCTGATGATGTGCCTTGTTGTGGTACCGAGTTTTTTCTGTTTGTGATGATTATCATAGGGCTGGTGTTGTTTGCTGGGTTGATGGCTGGTCTCACCCTCGGCCTCATGTCTCTTGGCCTTGTGGACCTCGAGGTTATCAGCAAATCAGGCCGCCCTCAAGATCGTAAACATGCCTCTAAAATACTTCCAGTGGTGAAAAATCAACACCTATTGCTTTGCACACTCTTGATTGGCAACTCTTTAGCAATGGAGTCGCT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057794060.1
MADDVPCCGTEFFLFVMIIIGLVLFAGLMAGLTLGLMSLGLVDLEVISKSGRPQDRKHASKILPVVKNQHLLLCTLLIGNSLAMESLPIFLDKLVPPWAAILVSVTLILMFGEILPQAICTRYGLTVGATVAPFVHLLLWVFFPIAYPISKILDWMLGKGHAALLRRAELKTFVDFHGNEAGKGGDLTHDETTIIAGALELTAKTAKDAMTSIAKAFSIDLDGTLNLETLNAIMTMGHSRVPVYYKNQNNIIGLILVKNL...

XP_057794061.1
MADDVPCCGTEFFLFVMIIIGLVLFAGLMAGLTLGLMSLGLVDLEVISKSGRPQDRKHASKILPVVKNQHLLLCTLLIGNSLAMESLPIFLDKLVPPWAAILVSVTLILMFGEILPQAICTRYGLTVGATVAPFVHLLLWVFFPIAYPISKAGKGGDLTHDETTIIAGALELTAKTAKDAMTSIAKAFSIDLDGTLNLETLNAIMTMGHSRVPVYYKNQNNIIGLILVKNLLAVDPDDSVPLRKMLIRKIPRVSEDMPLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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