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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003555`

染色体: Chr02 坐标: 56728232-56729347 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003555`
名称	SmilChr02G003555
描述	uncharacterized SmilChr02G003555
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56728232 - 56729347 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009781`
GeneID	`131009781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009781`
原始查询	`SmilChr02G003555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=50.7; qcov=1.01; evalue=1.33e-123; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=39; qcov=0.739; evalue=1.5e-58; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793172.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793172.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793172.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793172.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56728277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:56728282`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B131,B140,B95,C14,C17
`Chr2:56728282`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B131,B140,B95,C14,C17
`Chr2:56728357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B80,C60
`Chr2:56728432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr2:56728435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:56728501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C34
`Chr2:56728503`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B1,B118,B8,C47
`Chr2:56728503`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B1,B118,B8,C47
`Chr2:56728568`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr2:56728568`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr2:56728640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B29,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793172.1

371 aa

186

371

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 78-314 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 230-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793172.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	78	314	7.6e-94	314.4	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057793172.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	230	320	6.4e-09	36.4	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937189.1
ATGAATTATCCTCCAAATGAACGAGATGCGGTTAGGAGAGCATATATTTTGAAAAAGTCTTGTCAACCAAAAACTCATGATTTTCCTCGCAAAGACCTTGGAGGTTTGCGTCGATTTAGTGCTTCTTGGTTTGAAAAATGGGATTGGCTTGAATATAGTATTAAGAAAGATGCCGCATTTTATTTTATTTGCTATTTGTTCAAGAATAAAGTTGAGATTAATGTTGGTGGAGATGCATTTGTTAGTGGAGGATTTAAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009781
ATGAATTATCCTCCAAATGAACGAGATGCGGTTAGGAGAGCATATATTTTGAAAAAGTCTTGTCAACCAAAAACTCATGATTTTCCTCGCAAAGACCTTGGAGGTTTGCGTCGATTTAGTGCTTCTTGGTTTGAAAAATGGGATTGGCTTGAATATAGTATTAAGAAAGATGCCGCATTTTATTTTATTTGCTATTTGTTCAAGAATAAAGTTGAGATTAATGTTGGTGGAGATGCATTTGTTAGTGGAGGATTTAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793172.1
MNYPPNERDAVRRAYILKKSCQPKTHDFPRKDLGGLRRFSASWFEKWDWLEYSIKKDAAFYFICYLFKNKVEINVGGDAFVSGGFKPWNKPERFLKHVGGVKSAHNLAYEKYANLRDGKKKSILISFENATDVIQREYEIRLKASISCLRFLLGQGMAFRGHRENEESLNRGNFLELLKWLNTHNEVITKVTFENAPGNCQLISPIIQKDIINCCAKETTKRIVEELGDGYFAILADESSDVSQKEQLALCLRYVEEKMG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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