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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003567`

染色体: Chr02 坐标: 56846654-56848096 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003567`
名称	SmilChr02G003567
描述	zinc-finger homeodomain protein 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56846654 - 56848096 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010531`
GeneID	`131010531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010531`
原始查询	`SmilChr02G003567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc-finger homeodomain protein 5-like
产物	zinc-finger homeodomain protein 5-like
Arabidopsis	`AT1G14440` (HB31) homeobox protein 31 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838006] identity=51; qcov=0.813; evalue=8.85e-63; confidence=high
Rice	`Os09g0466400` (OsZHD1) - identity=46; qcov=0.911; evalue=7.17e-52; confidence=high
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0050793 (regulation of developmental process)
KEGG	-
Pfam	PF04770 (ZF-HD_dimer)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794075.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057794075.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794075.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794075.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56847401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr2:56847563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B140
`Chr2:56847602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D1
`Chr2:56847623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B1,B85,B9
`Chr2:56847656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B134,B47
`Chr2:56847728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794075.1

246 aa

123

246

ZF-HD_dimer

PF04770 ZF-HD_dimer 46-98 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794075.1`	Pfam	`PF04770`	ZF-HD_dimer	Family	46	98	3.1e-29	101.8	ZF-HD protein dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938092.1
GCTCAGATCGATTGTTAACCTCAGCAGTTGTTTCCCACTCATCTCTTCTCTCACCTCCCTCTCTCTCTCCTCCCCCTCCTTAGCTTCATCACAAGCAACCAACCTGTCTCTTGTTGGATACTTAGTTGGCTGTTGGAACCACTGCAACACACACCCCACTGCCACTAGTAATAATTCTTCCGTTTTTCCTATCAATTTTCACACCCTTTTTTTTTGTGAGCTAATCTGTCTTCCTTGAGCTCTCTTTAGTTGAGGTTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010531
ATGTCGTTACCTGGCGAAGACAAGGAAATGAGGGTACAAGGATACTCCCTCGAGAACCCGCCTGATAAATCGCGGGGCTCCGACCCGTATTCGGGCGGATCCAAGCACAAACCAGGCTCCAACAATCACCCGCGGGTGAGCTACCGCGAGTGCCTCAAGAACCACGCCGCCAACATCGGCGGCAACGTCACCGACGGCTGCGGCGAGTTCATGCCCAGCGGCGACGAGGGCAGCCTGGAGGCGCTCAAGTGCGCCGCCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794075.1
MSLPGEDKEMRVQGYSLENPPDKSRGSDPYSGGSKHKPGSNNHPRVSYRECLKNHAANIGGNVTDGCGEFMPSGDEGSLEALKCAACSCHRNFHRREHHGESPATAAMVHPLQLPPPLPSPSMSQHRAGTHWSPMVQPVKMAFGGAGSAGTDSSSEELNFNAFHSSAVAPPPPQFVAKKRFRTKFTAEQKEKMLEFAEKLGWRIPREDDTEVQRFCAEVGVKRQVFKVWMHNNKTSSSSKKIPQEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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