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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003595`

染色体: Chr02 坐标: 57149153-57153570 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003595`
名称	SmilChr02G003595
描述	uncharacterized SmilChr02G003595
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57149153 - 57153570 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009785`
GeneID	`131009785`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009785`
原始查询	`SmilChr02G003595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009785

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793176.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793176.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793176.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793176.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57149285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:57149620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr2:57149638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B35,B66,C11,C69,C78,C8
`Chr2:57149639`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B52
`Chr2:57149639`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B52
`Chr2:57149710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:57149712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr2:57149714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B67,B7,C33,C41
`Chr2:57149786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B7,C37,C4
`Chr2:57149821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:57149823`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	37	A20,A5,A8,A9,B1,B104,B109,B113,B134,B17,B21,B22,B26,B40,B50,B55,B59,B76,B80,B81,B82,B89,C1,C18,C29,C34,C35,C40,C44,C54,C6,C70,C81,C9,D1,D11,D8
`Chr2:57149832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B38,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793176.1

533 aa

266

533

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 362-509 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793176.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	362	509	2.4e-11	44.6	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937193.1
AGCATGCTGCGCCGTAACGTTGGATGGGCGCCATCTGTAATATTCGGTTTTTTGTGTAAACCGGCATCGAACTGGTTGCAAGCACTCGGGCTGGTTTTTTATTAACCCTGGTTCTAATTTTACACCCTAGTTACTTTTGTCGTATTCATTTCTAGGTATAGGGTTTCATTATGAATTTAATTCCCGATATGATATCGGGAAGATATCAAATTCGTCAATTTGTTCGGATTTTTTTTATTGTTTTGCTGAAGCTCGGTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009785
ATGCCTGTTGTGGAACCACAACAGGGGTCTGTTGTGGCATCGGCAGAGGAGCTCTGTATGCTTAATAAATTAGGAATGCCAAATACCACGTCATTTGCGGTAACCTCACCTCAATTGAATGAGAGTTTGAATAAGCTTTTCCCAAGTAGTCCAACCGATGTGCATTGTGAAACTGGAAATAGTCGTCGTGGTTGTGAAAAGTCTGTTAAATCACCGAGAAGGTGTTCGGATAGAATTCGTTCCCAAGGTAAGGTTATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793176.1
MPVVEPQQGSVVASAEELCMLNKLGMPNTTSFAVTSPQLNESLNKLFPSSPTDVHCETGNSRRGCEKSVKSPRRCSDRIRSQGKVMHCNKIAGKTVRDKDSMCKIVESDALEKDLTTNNFVSKGAPSLELKFMLNVVMESVKSLEVKFETRFCALEERLKQTELVLAELREAKICCRNSLGVKPPTLSSPVNVGFEDSGKVDLPSFSCKISHEEPSSHLSPVCEELPRSIYSEIFSAHSSQRTRSREAKIQKSLICSDVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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