当前解析结果
SmilChr02G003596| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003596 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003596 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003596 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 57151576 - 57152381 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009786 |
|---|---|
| GeneID | 131009786 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009786 |
| 原始查询 | SmilChr02G003596 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF09331 (DUF1985) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009786 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793177.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057793177.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057793177.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793177.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793177.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:57151702 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:57151706 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:57151709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A6,B49 |
Chr2:57151729 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B35,B66,C78,C8 |
Chr2:57151729 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B66,C78,C8 |
Chr2:57151733 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A6,B49 |
Chr2:57151742 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B48,B98,C35,C61,C80 |
Chr2:57151795 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B52,D11,D6 |
Chr2:57151926 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B30,B7,C37,C4 |
Chr2:57151968 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B48,B98,C35,C61,C80 |
Chr2:57151983 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C82,D6 |
Chr2:57151993 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C82,D6 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057793177.1PF09331
DUF1985 66-184 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057793177.1 |
Pfam | PF09331 |
DUF1985 | Family | 66 | 184 | 1e-10 | 42.5 | Domain of unknown function (DUF1985) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。