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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003608`

染色体: Chr02 坐标: 57314820-57319602 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003608`
名称	SmilChr02G003608
描述	bifunctional nuclease 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57314820 - 57319602 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010570`
GeneID	`131010570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010570`
原始查询	`SmilChr02G003608`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bifunctional nuclease 1-like
产物	bifunctional nuclease 1-like
Arabidopsis	`AT1G75380` (BBD1) bifunctional nuclease in basal defense response 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843874] identity=67.5; qcov=1; evalue=1.24e-156; confidence=high
Rice	`Os08g0357000` (BBD2) - identity=60.9; qcov=1.02; evalue=1.48e-139; confidence=high
GO	GO:0004518 (nuclease activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0030891 (VCB complex)
KEGG	-
Pfam	PF02577 (BFN_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057794126.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057794126.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794126.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794126.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57315161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr2:57316138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:57317895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr2:57317933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr2:57318396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794126.1

322 aa

161

322

BFN_dom

PF02577 BFN_dom 136-250 aa

XP_057794127.1

322 aa

161

322

BFN_dom

PF02577 BFN_dom 136-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794126.1`	Pfam	`PF02577`	BFN_dom	Domain	136	250	6.4e-22	78.2	Bifunctional nuclease domain
`XP_057794127.1`	Pfam	`PF02577`	BFN_dom	Domain	136	250	6.4e-22	78.2	Bifunctional nuclease domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938144.1
TTGTTTTTTCTGAAAAAATGAAAAGAAGAATCTTCAAGAACGGAAAAATACTGACCAGGAAAGGAAAAGGAAAGGGATTAGAAAAAAAATATCTGCGTGGGGATATTTTGCTTAATTTCTTTTCATCTCCATGAAGAAAATGGAAATGGCCAAATGCTGTGCTGAATTACATGTATGCAAAAGGGCACATCCGTCTTTAGGCACATCACAAATCACAATTCACAATTCAGATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTTCA...

XM_057938143.1
GGGATTAGAAAAAAAATATCTGCGTGGGGATATTTTGCTTAATTTCTTTTCATCTCCATGAAGAAAATGGAAATGGCCAAATGCTGTGCTGAATTACATGTATGCAAAAGGGCACATCCGTCTTTAGGCACATCACAAATCACAATTCACAATTCAGATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTTCATTTGAGATCAACCTATTGCGTGAAGTCATAATCTCATGCTCTGATTTATTCTGATCAGAAAACTAAAATTTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010570
ATGGCTTCAATACAGGGCCCGGTAGTTTGTCCTGTGGTCAATGCAAAACAAACTGGGGTATACTCTGTACCCGTCGATTCGTCTCTGCTAAAATCTAAGTTGAGTGGATTTTGGGGGCTGAAAGGGATTAACAGCGGCGTGGCTAATGTCAGTTATCGACAGAATTTGAGGAATTGCAGACAAATTCGGGGTAGTTTCAGTTCATCATCAGATGGTAATGGTAGCATGGCAGAAAATTTCAGTGAGAATAATGCAGATTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794126.1
MASIQGPVVCPVVNAKQTGVYSVPVDSSLLKSKLSGFWGLKGINSGVANVSYRQNLRNCRQIRGSFSSSSDGNGSMAENFSENNADYVNSSVVEAVEVRSGTDGFMIKMRDGGYLRCAHNNPQGGHLPDYAPHPAIVLKMEDGTGLLLPIIVLEMPSVLLMAAVRNVQIARPTMYQVVKEMVDKMGYTVKLVRVTKRVQEAYFAELHLAKLDNEAETLCFDLRPSDAINIAVRCKVPIQVNKSLAYSDGMKVIEAEKVTA...

XP_057794127.1
MASIQGPVVCPVVNAKQTGVYSVPVDSSLLKSKLSGFWGLKGINSGVANVSYRQNLRNCRQIRGSFSSSSDGNGSMAENFSENNADYVNSSVVEAVEVRSGTDGFMIKMRDGGYLRCAHNNPQGGHLPDYAPHPAIVLKMEDGTGLLLPIIVLEMPSVLLMAAVRNVQIARPTMYQVVKEMVDKMGYTVKLVRVTKRVQEAYFAELHLAKLDNEAETLCFDLRPSDAINIAVRCKVPIQVNKSLAYSDGMKVIEAEKVTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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