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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003610`

染色体: Chr02 坐标: 57353334-57356373 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003610`
名称	SmilChr02G003610
描述	uncharacterized SmilChr02G003610
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57353334 - 57356373 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009787`
GeneID	`131009787`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009787`
原始查询	`SmilChr02G003610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=44.8; qcov=0.264; evalue=6.63e-31; confidence=weak
Rice	`Os08g0202300` - identity=49.8; qcov=0.493; evalue=2.24e-79; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009787

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793178.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793178.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793178.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793178.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793178.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793178.1

473 aa

236

473

RVT_1

SH3_Tf2-1

PF00078 RVT_1 2-145 aa PF24626 SH3_Tf2-1 360-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793178.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	2	145	2.7e-33	116.2	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057793178.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	360	425	8.4e-28	97.0	Tf2-1-like, SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937195.1
GAACTGAACAAAGTGACACTGAAGAACAAATATCCTTTACCAAGGATAGATGACCTCTTCGACCAGCTCAAGGGAGCAAGCGTGTTCTCGAAGATTGATTTGCGGTCTGGTTATCACCAGCTGAAGATTCGACCAGAAGACGTACCTAAGACGGCATTTCGAACTAGGTATGGCCACTACGAATTTGTAGTTGTGCCATTCGGGCTAACTAATGCGCCAGCCGTGTTCATGGACCTCATGAATCGAGTGTTCCATCCGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009787
GAACTGAACAAAGTGACACTGAAGAACAAATATCCTTTACCAAGGATAGATGACCTCTTCGACCAGCTCAAGGGAGCAAGCGTGTTCTCGAAGATTGATTTGCGGTCTGGTTATCACCAGCTGAAGATTCGACCAGAAGACGTACCTAAGACGGCATTTCGAACTAGGTATGGCCACTACGAATTTGTAGTTGTGCCATTCGGGCTAACTAATGCGCCAGCCGTGTTCATGGACCTCATGAATCGAGTGTTCCATCCGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793178.1
ELNKVTLKNKYPLPRIDDLFDQLKGASVFSKIDLRSGYHQLKIRPEDVPKTAFRTRYGHYEFVVVPFGLTNAPAVFMDLMNRVFHPYLDKFVLVFIDDILIYSKNDKDHEEHLRIVLETLRTERLYAKFSKCEFWLSEVTFLGHIVSSEGIKVDPEKVQAVREWKSPTNPNEIRSFLGLAGYYRRFMEGFSKIARPMTQLLRKGIKFSWTEECEKSFQELKKKLTTAPVLAVPPGKANVVADALSHGQSERTIQTLEDML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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