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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003611`

染色体: Chr02 坐标: 57365102-57365557 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003611`
名称	SmilChr02G003611
描述	uncharacterized SmilChr02G003611
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57365102 - 57365557 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009788`
GeneID	`131009788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009788`
原始查询	`SmilChr02G003611`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G22935` (AT3G22935) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719306] identity=33.6; qcov=0.689; evalue=1.64e-08; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=50.7; qcov=0.47; evalue=1.31e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793179.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793179.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793179.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793179.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793179.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57365117`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A3,A5,B133,B3,C20,C23,C43,C76,C84
`Chr2:57365212`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A14,A20,A3,A5,B102,B127,B133,B136,B3,B45,B50,B53,B70,B79,B97,C20,C22,C30,C36,C42,C43,C48,C59,C76,C84,C87
`Chr2:57365241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:57365254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:57365273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:57365294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:57365360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:57365373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C70,C83
`Chr2:57365378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:57365383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:57365412`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C70,C83
`Chr2:57365412`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C70,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793179.1

151 aa

151

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 1-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793179.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	1	69	2.9e-24	86.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937196.1
ATGCTAGGGAGCCTCGATTGCATGCATTGGGCGTGGAAGAATTATCCAACGGCATGCAAGACACATACACTCGCGGCGACCAGAGGGAATCGACCATCATCCTCGAAGTCGTCGCATCTATGGATCTGGCATGCCTTTTTTGGGACTCCTGCTTCGAACAACGACATCAACGTGCTCAACTCTTCGAAGTTGTTCAACGACATGATGTTCACGTGCATCATTTTGCACAACATGATCATCGAAGACGAAGGCGAGCATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009788
ATGCTAGGGAGCCTCGATTGCATGCATTGGGCGTGGAAGAATTATCCAACGGCATGCAAGACACATACACTCGCGGCGACCAGAGGGAATCGACCATCATCCTCGAAGTCGTCGCATCTATGGATCTGGCATGCCTTTTTTGGGACTCCTGCTTCGAACAACGACATCAACGTGCTCAACTCTTCGAAGTTGTTCAACGACATGATGTTCACGTGCATCATTTTGCACAACATGATCATCGAAGACGAAGGCGAGCATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793179.1
MLGSLDCMHWAWKNYPTACKTHTLAATRGNRPSSSKSSHLWIWHAFFGTPASNNDINVLNSSKLFNDMMFTCIILHNMIIEDEGEHATQWEEEVVNEASSTAAASRPCAGVPPDFRTFVARQASLKDAEMHARLALDLKECIWSRFSLIEP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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