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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003618`

染色体: Chr02 坐标: 57479981-57481324 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003618`
名称	SmilChr02G003618
描述	uncharacterized SmilChr02G003618
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57479981 - 57481324 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009792`
GeneID	`131009792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009792`
原始查询	`SmilChr02G003618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793182.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793182.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057793182.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057793182.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057793182.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57480023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:57480057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:57480111`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	170	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A21,A22,A23,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B105,B106,B107,B110,B111,B114,B115,B118,B119,B12,B121,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B135,B136,B138,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B24,B25,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B35,B36,B40,B41,B42,B43,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B86,B87,B88,B89,B90,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C16,C17,C18,C19,C20,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C33,C35,C36,C4,C40,C43,C44,C46,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C71,C72,C73,C75,C77,C78,C80,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D4,D5,D9
`Chr2:57480124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B128,C19,C24,C61,C85
`Chr2:57480124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,C19,C24,C61,C85
`Chr2:57480126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,C19,C24,C61,C85
`Chr2:57480133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B91,D6,D7
`Chr2:57480145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:57480155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B31,B54,C42,C47
`Chr2:57480174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:57480187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C5,C51
`Chr2:57480238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B101,B34,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793182.1

447 aa

224

447

RRM_1

PF00076 RRM_1 46-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793182.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	46	111	2.8e-07	31.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937199.1
ATGGAGAGAGAAGGCGAAGGTGAGTGGAGAGAAGTGAGGAGGAGGGGGAGAGGAGCGAGCAGCTATTCCAAAACTCAGAGAACCGGCGCTAGGTTTGACAACAAAGTGATGGAAAATAGTGTTTCTTTCTTCTTCAACAATTTTCCGGAAGGGACTTGGATGGAAACTCTTGAGAATAGGTTCGCCAGAGTCGGTAAAGTTTTGGATATCTTCTGCCCAAGAAAGAGATACTTGAAAGGCAAACCCTTCGGCTTCGTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009792
ATGGAGAGAGAAGGCGAAGGTGAGTGGAGAGAAGTGAGGAGGAGGGGGAGAGGAGCGAGCAGCTATTCCAAAACTCAGAGAACCGGCGCTAGGTTTGACAACAAAGTGATGGAAAATAGTGTTTCTTTCTTCTTCAACAATTTTCCGGAAGGGACTTGGATGGAAACTCTTGAGAATAGGTTCGCCAGAGTCGGTAAAGTTTTGGATATCTTCTGCCCAAGAAAGAGATACTTGAAAGGCAAACCCTTCGGCTTCGTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793182.1
MEREGEGEWREVRRRGRGASSYSKTQRTGARFDNKVMENSVSFFFNNFPEGTWMETLENRFARVGKVLDIFCPRKRYLKGKPFGFVRFEGGADITRTLEELNNIWIGSYKMRAYVPKFERPRTEEQKKRTENRPEVQQSRFPVSKTDHNFARQAHLIPKGLRQSGKSFAEAIGGSAVPPADEIIGFQTTEEERTWLLKSFTGYVKSDFLWEDFEEEINSECASMLRISSLGGNLVIIQSIDHRPVQELLNGLDEWVSFWF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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