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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003632`

染色体: Chr02 坐标: 57670920-57673337 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003632`
名称	SmilChr02G003632
描述	probable polygalacturonase At1g80170
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57670920 - 57673337 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010590`
GeneID	`131010590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010590`
原始查询	`SmilChr02G003632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase At1g80170
产物	probable polygalacturonase At1g80170
Arabidopsis	`AT1G23460` (AT1G23460) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838954] identity=73.8; qcov=0.846; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0130200` (OsPGL15) - identity=54.7; qcov=0.833; evalue=7.92e-158; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057794160.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057794160.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057794160.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794160.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794160.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57671404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:57671611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:57671657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C61
`Chr2:57671673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:57672216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:57672327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,A8
`Chr2:57672467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:57672615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C5,D10
`Chr2:57672627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr2:57672636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B31,C85
`Chr2:57672676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:57672719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794160.1

456 aa

228

456

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 96-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794160.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	96	416	6.4e-91	305.5	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938177.1
AGCAATCTCTCATTAGTCAGAAGATACAACAAGTTGTAAAACATATCAGTGGAGTTGGGCACTAGTTTAAGAGTAAAGCAAAGTTTTTGAAATTTATACATTCTTACCCTTGAAGAGTAGGCATATCAACAAAATGTAACACATTCATGCCCTTTCAAGTCAAGACACATCCCTCCCTCCACAAAAACCCATTGCACTTTACAAACTCAATCCGTAGTTATATAGTAATCCCACAATCTCTTACACAAATCAAGTAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010590
ATGAACAAGTTACTAACGTTCCTTTGCTTTCTTGTTTTGCTTCTGGTTCCCCTTTCAAGAGCTGGCCAAGATCCCTCCGACACATTTGAGGTCTTTGCCAAGCTCCATGACTTCGATGTGGAAGACGAAGACGACGTGTTGGAGGCCTTAGACGTCCCATCTTGGCATAGTGGCCATAGCAACAAAGTTCTTGTCAATGTGGATGGATTTGGTGCTGTTGGAGATGGTGTAGCTGATGATACTCAGGCCTTCATCAATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794160.1
MNKLLTFLCFLVLLLVPLSRAGQDPSDTFEVFAKLHDFDVEDEDDVLEALDVPSWHSGHSNKVLVNVDGFGAVGDGVADDTQAFINAWKQACSTPKSVLLVPEGRRYLVNATRFRGPCADRIVIQIEGTIVAPDDPKSWDPKNPRTWLVFNNLTKVYFQGKGVIDGSGTKWWAASCKKNKSNPCESAPTALTIESSSAVRVKGITVKNGQQMNFVIGRSDSVRVIDVKVSAPEDSPNTDGIHITQSTNVVLQNCKIGTGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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