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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003644`

染色体: Chr02 坐标: 57799988-57802024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003644`
名称	SmilChr02G003644
描述	syntaxin-related protein KNOLLE-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57799988 - 57802024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009798`
GeneID	`131009798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009798`
原始查询	`SmilChr02G003644`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-related protein KNOLLE-like
产物	syntaxin-related protein KNOLLE-like
Arabidopsis	`AT1G08560` (SYP111) syntaxin of plants 111 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837378] identity=74.7; qcov=0.861; evalue=1.82e-45; confidence=medium
Rice	`Os03g0736500` (KN) - identity=70.1; qcov=0.861; evalue=1.42e-38; confidence=medium
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006887 (exocytosis); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012505 (endomembrane system); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0048278 (GO:0048278)
KEGG	-
Pfam	PF05739 (SNARE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793188.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057793188.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057793188.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793188.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793188.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57799991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C49,D8
`Chr2:57800009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A25,A7,B134,B3,B37,B47,B66,B90,B92,B95,C21,C71,C72,C73,C79
`Chr2:57801805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C61,C64
`Chr2:57801814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,C43,C55,D8
`Chr2:57801856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C43,C55,D8
`Chr2:57801859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B46
`Chr2:57801914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C51,C67
`Chr2:57801934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B83,C15
`Chr2:57801946`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr2:57801946`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr2:57801966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:57801995`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793188.1

101 aa

101

SNARE

PF05739 SNARE 21-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793188.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	21	97	5e-27	94.3	SNARE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937205.1
ATGCGGGCTTTGATCACAGTGCAGGAGCACGGGAGGGGGAAGGTGGTGGAGACGGTGGCGGAGATACAGGACCGGCACGACGCGGCGAAGGAGATCGAGAGGAGCCTGCTGGAGCTGCACCAGATATTCCTGGACATGGCGGTGATGGTGGAGGCGCAGGGGGAGCAGATGGACGACATCGAGCACCACGTCGTCAACGCGACGCAGTACGTCGGCGACGGGACGAAGAGCCTCAAGGTGGCGAAGGATCACCAGAGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009798
ATGCGGGCTTTGATCACAGTGCAGGAGCACGGGAGGGGGAAGGTGGTGGAGACGGTGGCGGAGATACAGGACCGGCACGACGCGGCGAAGGAGATCGAGAGGAGCCTGCTGGAGCTGCACCAGATATTCCTGGACATGGCGGTGATGGTGGAGGCGCAGGGGGAGCAGATGGACGACATCGAGCACCACGTCGTCAACGCGACGCAGTACGTCGGCGACGGGACGAAGAGCCTCAAGGTGGCGAAGGATCACCAGAGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793188.1
MRALITVQEHGRGKVVETVAEIQDRHDAAKEIERSLLELHQIFLDMAVMVEAQGEQMDDIEHHVVNATQYVGDGTKSLKVAKDHQRSSRRCLCIGIILLSI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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