当前解析结果
SmilChr02G003659| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003659 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003659 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003659 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 57965040 - 57967019 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009800 |
|---|---|
| GeneID | 131009800 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009800 |
| 原始查询 | SmilChr02G003659 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=26; qcov=0.619; evalue=1.2e-27; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009800 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057793189.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057793189.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057793189.1 |
| 4 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057793189.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793189.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:57965068 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B10,B130,B44,B54,C12 |
Chr2:57965068 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B10,B130,B44,B54,C12 |
Chr2:57965073 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A22,B1,B65,B81,C5,D9 |
Chr2:57965096 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B81,C47,C57 |
Chr2:57965158 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B55 |
Chr2:57965162 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B4,B55 |
Chr2:57965177 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B66,C41 |
Chr2:57965238 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr2:57965239 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C12,C47,C74 |
Chr2:57965254 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
Chr2:57965271 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B113,B134,B40,B41,C26 |
Chr2:57965296 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C84 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。