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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003679`

染色体: Chr02 坐标: 58159880-58161292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003679`
名称	SmilChr02G003679
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58159880 - 58161292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009802`
GeneID	`131009802`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009802`
原始查询	`SmilChr02G003679`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=41.7; qcov=0.46; evalue=1.25e-25; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=51.6; qcov=0.899; evalue=4.12e-87; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009802

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057793192.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793192.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793192.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793192.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793192.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58159885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B93,C2
`Chr2:58159886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B74,C1,C61,C66
`Chr2:58159943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B136,B20,B27,C25
`Chr2:58159952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A8,B119,B123,B137,B17,B31,B56,B93
`Chr2:58159953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	B104,B11,B131,B22,B26,B32,B35,B5,B71,B76,B89,B90,B92,B94,C15,C19,C25,C30,C53,C70,C81,D6
`Chr2:58159960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr2:58159969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B119,B123,B56,B93
`Chr2:58159980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B123
`Chr2:58159981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B123,B77
`Chr2:58160001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B123
`Chr2:58160008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B123
`Chr2:58160021`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B70,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793192.1

276 aa

138

276

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 81-276 aa PF13359 DDE_Tnp_4 111-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793192.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	81	276	2.5e-69	233.7	Plant transposon protein
`XP_057793192.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	111	270	1.5e-06	28.6	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937209.1
ATGGATAGTGGTCGCGCTGGAGTGTCGATCTGGCTCGAGCGTGGCCCAAATGATGGTGTCGATCACGGACGCTATTTTTACCCGACTTCACACTGCTGCAAGAAATGCACAGTTGCTATTCGTCAACTGGAAAATAGAGGTGCAACTGACCGATACGACGAGTACTTGCGGATTGCAGAGTCTACCTCGTTGGAGTGCTTGAGCAGATTCTGTCGAGTCATCATCCAACTATTTGGTGCAGAATACTTAAGGAGACCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009802
ATGGATAGTGGTCGCGCTGGAGTGTCGATCTGGCTCGAGCGTGGCCCAAATGATGGTGTCGATCACGGACGCTATTTTTACCCGACTTCACACTGCTGCAAGAAATGCACAGTTGCTATTCGTCAACTGGAAAATAGAGGTGCAACTGACCGATACGACGAGTACTTGCGGATTGCAGAGTCTACCTCGTTGGAGTGCTTGAGCAGATTCTGTCGAGTCATCATCCAACTATTTGGTGCAGAATACTTAAGGAGACCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793192.1
MDSGRAGVSIWLERGPNDGVDHGRYFYPTSHCCKKCTVAIRQLENRGATDRYDEYLRIAESTSLECLSRFCRVIIQLFGAEYLRRPTPTDYQRHLAHHEKTHEFSRMLGSLDCTHWARKNCLVAWQGAYTRGDHGEPTIILEAVASQDLWICHAFFGTPGSNNGINVLNASLLFNVRRERRAPPITYQVSNSYYTSGYYLIDWPTYMKSPPLPSNKKSMRFKLMQKAARKDIESAFGVLQAHWAIIKGPTRLWKKEKLSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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