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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003698`

染色体: Chr02 坐标: 58442565-58448672 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003698`
名称	SmilChr02G003698
描述	auxin-responsive protein IAA8-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58442565 - 58448672 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010652`
GeneID	`131010652`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010652`
原始查询	`SmilChr02G003698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-responsive protein IAA8-like
产物	auxin-responsive protein IAA8-like
Arabidopsis	`AT5G65670` (IAA9) indole-3-acetic acid inducible 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836693] identity=52.1; qcov=0.997; evalue=7.38e-113; confidence=high
Rice	`Os12g0601300` (OsIAA30) - identity=59.9; qcov=0.522; evalue=6.93e-67; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02309 (AUX_IAA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010652

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794266.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794266.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794266.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794266.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794266.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58443797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B24,B33,C48
`Chr2:58444014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:58444018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:58444210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B140,B86
`Chr2:58444273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58444281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58444298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58444331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B132,B9,C10,C67
`Chr2:58444386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A7,B108,B2,C42
`Chr2:58444623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B47,C34,D9
`Chr2:58444624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,C26,C64,C66
`Chr2:58444639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794266.1

358 aa

179

358

AUX_IAA

PF02309 AUX_IAA 70-349 aa

XP_057794268.1

358 aa

179

358

AUX_IAA

PF02309 AUX_IAA 70-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794266.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	70	349	3.3e-87	292.6	AUX/IAA family
`XP_057794268.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	70	349	3.3e-87	292.6	AUX/IAA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938283.1
GAAATAGATGGAGCTAGGAAGGGAGTACTTTCTCTCTCTCTCTCTTTGTCTCTCTTCTCATTTTTACGGAGTACTTGTTAAATTATTAGGCCACACTCCAATTCTATCTCCCACACCAAAATCTACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGGAAGGTCCTTAGTTTTTCTCTCCGCTGTCCGAATTTCTCCTGTAATCCTCAACTTCCGCTAATTCACTGTTTTACTAAGTTAAGAACTGGACTATAACCTAAAAACTTGATG...

XM_057938285.1
TAGATGGAGCTAGGAAGGGAGTACTTTCTCTCTCTCTCTCTTTGTCTCTCTTCTCATTTTTACGGAGTACTTGTTAAATTATTAGGCCACACTCCAATTCTATCTCCCACACCAAAATCTACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGGAAGGTCCTTAGTTTTTCTCTCCGCTGTCCGAATTTCTCCTGTAATCCTCAACTTCCGCTAATTCACTGTAGTTTTACTAAGTTAAGAACTGGACTATAACCTAAAAACTTGATGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010652
ATGTCTGCACCTCTGCTCGGTGTTGGTGGGGACGAGTATCAAAGCAACATTACCTTGCTGGCTTCTTCAACCTCCTTGGAAAGTGTCTGCCAAAATGGATCAGAACTCAAGGAGCGGAACTACATGGGGCTATCTGACTGTTCATCTGTTGATAGCTCGACAATATCCAGCACCTCAGAATACAGTCCCAGTGGTCTGAACATAAAGGCCACAGAACTAAGGCTTGGGCCCCCAGGATCCCTGTCTCTGGAGAGGGGTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794266.1
MSAPLLGVGGDEYQSNITLLASSTSLESVCQNGSELKERNYMGLSDCSSVDSSTISSTSEYSPSGLNIKATELRLGPPGSLSLERGSERCPVSSATNDEKLLFPLHPLKALVTGNKRGFSDAMNGTSEGKHVNALEVNTVLSPRPSSNPNVKASKEVSAAAQPTKVKEAVYQGAALEMPHAPNESRPGHVVATNNYTSAPATKAQVVGWPPVRQIRKNTLTSSSKNTEEVDGKASNGASFVKVSMDGAPYLRKVDLRNYS...

XP_057794268.1
MSAPLLGVGGDEYQSNITLLASSTSLESVCQNGSELKERNYMGLSDCSSVDSSTISSTSEYSPSGLNIKATELRLGPPGSLSLERGSERCPVSSATNDEKLLFPLHPLKALVTGNKRGFSDAMNGTSEGKHVNALEVNTVLSPRPSSNPNVKASKEVSAAAQPTKVKEAVYQGAALEMPHAPNESRPGHVVATNNYTSAPATKAQVVGWPPVRQIRKNTLTSSSKNTEEVDGKASNGASFVKVSMDGAPYLRKVDLRNYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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