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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003701`

染色体: Chr02 坐标: 58476983-58484681 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003701`
名称	SmilChr02G003701
描述	uncharacterized SmilChr02G003701
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58476983 - 58484681 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009804`
GeneID	`131009804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009804`
原始查询	`SmilChr02G003701`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=26.4; qcov=0.51; evalue=2.95e-34; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=31.8; qcov=0.737; evalue=1.81e-100; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793193.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793193.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793193.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793193.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793193.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58476990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:58476992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B105,B110,B98,C30,C5,C61
`Chr2:58477003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr2:58477003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:58477024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:58477037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,A7,B104,B4,D11
`Chr2:58477047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B47
`Chr2:58477048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:58477064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B24,B33,C48
`Chr2:58477692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B24,B33,C48
`Chr2:58477694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B44,B5,C49
`Chr2:58477715`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A5,A9,B108,B13,B139,B18,B2,B38,B39,B50,C27,C30,C36,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793193.1

900 aa

450

900

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 62-320 aa PF13966 zf-RVT 597-691 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793193.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	62	320	2.2e-34	119.8	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057793193.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	597	691	2.5e-16	60.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937210.1
ATGGAAATTCGAGAGGCCATTTGGAGTTGCGACGGGGACAAGAGTCCGGGACCAGATGGCTTTAACTTCAAGTTCTGGAAAGCGTCATGGGAGATTATCAAGAAGGACTTCTTAAAGGTGATGAGTGAATTCCACGCCAATGGCAAAATTCCGCGGGGATGCAACTCCTCATTCATCGTCCTCATTCCAAAAAAAGAAGGAGCTTGCTCGCTCGAGGAGTTTAGACCTATCTCACTTATCTGTAGTCTCTACAAAGTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009804
ATGGAAATTCGAGAGGCCATTTGGAGTTGCGACGGGGACAAGAGTCCGGGACCAGATGGCTTTAACTTCAAGTTCTGGAAAGCGTCATGGGAGATTATCAAGAAGGACTTCTTAAAGGTGATGAGTGAATTCCACGCCAATGGCAAAATTCCGCGGGGATGCAACTCCTCATTCATCGTCCTCATTCCAAAAAAAGAAGGAGCTTGCTCGCTCGAGGAGTTTAGACCTATCTCACTTATCTGTAGTCTCTACAAAGTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793193.1
MEIREAIWSCDGDKSPGPDGFNFKFWKASWEIIKKDFLKVMSEFHANGKIPRGCNSSFIVLIPKKEGACSLEEFRPISLICSLYKVIAKILANRMKKVMDSVISDNQSAFIGGRYILDGVVVLNEAIAEASKKRKGRIFFKVDFAKAYDSVEWDFLDTMLERMDFEPRWRKWIRGCISSATTNILVNGSPSGELSLERGLRQGDPLSPFLFLVAAEGLHSLITRAVEKELIQPAKVGNDCITISHLQYADDTVFLVEDEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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