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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003705`

染色体: Chr02 坐标: 58576139-58577744 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003705`
名称	SmilChr02G003705
描述	uncharacterized SmilChr02G003705
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58576139 - 58577744 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010658`
GeneID	`131010658`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010658`
原始查询	`SmilChr02G003705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010658

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794278.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794278.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794278.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794278.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794278.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58576483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B82
`Chr2:58576489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C73
`Chr2:58576513`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A23,A24,B112,B120,B137,B54,B61,B83,B86,C21,C4,C57,C59,C73,C87,D8
`Chr2:58576514`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	171	A1,A11,A13,A14,A16,A19,A2,A20,A21,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B112,B113,B115,B117,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B16,B17,B19,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B30,B31,B32,B33,B36,B4,B42,B43,B45,B46,B49,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B77,B8,B80,B81,B83,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C16,C18,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C68,C69,C7,C70,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D7,D8,D9
`Chr2:58576515`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A22,B122,B21,B41,B5,C18,C56,C70
`Chr2:58576516`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B41,B62,C15,D9
`Chr2:58576516`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B41,B62,C15,D9
`Chr2:58576522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B125
`Chr2:58576532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B46
`Chr2:58576536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B122
`Chr2:58576567`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B137,B139,B54,B83,B86,C21,C24,C4,C5,C59,C73,C82,C87
`Chr2:58576572`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A23,A7,B120,B130,B137,B3,B30,B54,B61,B73,B80,B83,B84,B86,C21,C22,C35,C40,C53,C57,C59,C87,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794278.1

177 aa

177

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 43-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794278.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	43	165	3.9e-10	40.7	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938295.1
ACATTGAATCTGATTGAGTAATCAATTACTTCAAATAAAACATATTTGTCAATTTTATATATTTAGTGTGGTCAACAATAAAATAAACAAACTAATATATTAATTACTTCAAATTTGGATATAGATGTCTACTTCTACTCCATCCGATTCTGGTCCTACGATCACTGATACGCCGCCCGAGGATGAAAACCCCAATGTGGAGGAGGAACGTGTTGCTAGAGATGGCCGGACATGGGTGTATTTCACTCGTAGGTAAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010658
ATGCAGGCTATTAAGAAAGCGTGGGTTAAGTCGGCTCGAGTGGCGTATAAGGATTACATCTCCAATTGCAAGAAGGTCCTTTTGATACATAGCAAGACGATTGATTATCTTCAGCCTAACATTGAGGCTGCTTGGAGGGCTTATTGGGCTTTGCCTGAGACTCAGGCAAGGTCTGCTCAGGCGTCCAGGAATCGCCGCTCAGAGCCATGCGGTCCGGGTACAGGGATGGCTATCCATCATGGAGGGTCGCATAGTGCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794278.1
MQAIKKAWVKSARVAYKDYISNCKKVLLIHSKTIDYLQPNIEAAWRAYWALPETQARSAQASRNRRSEPCGPGTGMAIHHGGSHSAIDHAEHLARESNIPFDEASWATFRRIHYKNGQYTAGRPAQHGLEVERRLAELRQTQEEVTLSDVDRIFREVVTLDPRGHHGIRHDDVQGDY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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