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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003735`

染色体: Chr02 坐标: 58981685-58984282 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003735`
名称	SmilChr02G003735
描述	putative receptor protein kinase ZmPK1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58981685 - 58984282 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010678`
GeneID	`131010678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010678`
原始查询	`SmilChr02G003735`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative receptor protein kinase ZmPK1
产物	putative receptor protein kinase ZmPK1
Arabidopsis	`AT2G19130` (AT2G19130) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816430] identity=31.6; qcov=0.995; evalue=1.54e-104; confidence=low
Rice	`Os01g0668400` - identity=41.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00954 (S_locus_glycop); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794319.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794319.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794319.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794319.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794319.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58981785`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B122,B26,B93,C16,C2
`Chr2:58981785`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B122,B26,B93,C16,C2
`Chr2:58982080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B54
`Chr2:58982155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:58982261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B29,B6,C52,C67
`Chr2:58982552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr2:58982768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:58982797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B103,B109,B129,B20,B36,C74
`Chr2:58983004`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A1,A13,A14,A25,B117,B129,B134,B35,B41,B45,B5,B54,B61,B67,B88,B9,C15,C19,C20,C26,C27,C3,C49,C53,C54,C56,C58,C6,C65,D5
`Chr2:58983083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:58983167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B68,C32,C68
`Chr2:58983233`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794319.1

783 aa

392

783

B_lectin

S_locus_glycop

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF01453 B_lectin 80-180 aa PF00954 S_locus_glycop 258-323 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 518-780 aa PF00069 Pkinase 519-778 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794319.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	80	180	4.7e-24	85.6	D-mannose binding lectin
`XP_057794319.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	258	323	5.9e-09	37.2	S-locus glycoprotein domain
`XP_057794319.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	518	780	6.5e-42	144.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057794319.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	519	778	3.1e-51	175.0	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938336.1
AATATGTTAATCATAATAATAATAAAATATGTTTCATACAAATATACATGTCAAAATATAAATTTAAAAGATATATTAAGAATGAAACGGAATGGCTTATAAATATACTAGTATCGTTTGAATCCAAAATACCAGTAAACTATAGCAATGGAAGTTCATCTTCCCAAACTTGTTATCCTAACTTTGATTCCAATATTCTTACCACTTTCATCCTCCTCCAAAACCTATACAAGTTTAACTCAAGGTTCATCCCTCTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010678
ATGGAAGTTCATCTTCCCAAACTTGTTATCCTAACTTTGATTCCAATATTCTTACCACTTTCATCCTCCTCCAAAACCTATACAAGTTTAACTCAAGGTTCATCCCTCTCTTCACCCCATGACGTGTTGGTCTCATCACCAATGGGCATTTTCACCGCCGGTTTTTACGCCGTCGGCGATAACGCCTACTGTTTTTCCATCTGGTTCACTCACGCTCGTGAGGCCAACGGAAATCAAACCGTGGTTTGGATGGCGAACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794319.1
MEVHLPKLVILTLIPIFLPLSSSSKTYTSLTQGSSLSSPHDVLVSSPMGIFTAGFYAVGDNAYCFSIWFTHAREANGNQTVVWMANRDQPVSGKHTKLSLLHSGSLILRDAGQLTVWTSGTASAAEVVVLKLHDNGDLVLRNEKNTSRVIWRSFDSPTHTLLPEQALTAKAELVSSRSLTNQSSGFYKLYFDNDNVLRLMYSGFEMTSVFWPVPWKNSWEAGRSTYNSSKTAVLDLYGRFSSTDDFKFNTSDLGVGPRRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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