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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003738`

染色体: Chr02 坐标: 59042728-59043793 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003738`
名称	SmilChr02G003738
描述	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59042728 - 59043793 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010711`
GeneID	`131010711`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010711`
原始查询	`SmilChr02G003738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
产物	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
Arabidopsis	`AT4G33800` (AT4G33800) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829522] identity=36.5; qcov=0.777; evalue=1.96e-11; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF30936 (SOFL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010711

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794360.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057794360.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057794360.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057794360.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794360.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59043056`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A5
`Chr2:59043056`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A5
`Chr2:59043065`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A5
`Chr2:59043065`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A5
`Chr2:59043109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,D9
`Chr2:59043165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B114,B130,D3
`Chr2:59043509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:59043659`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A1,A15,A25,A3,A7,A8,B110,B117,B119,B131,B136,B2,B20,B24,B45,B5,B52,B56,B62,B67,B71,B72,B75,B85,B88,B89,B9,B94,B96,B97,B99,C10,C12,C13,C19,C26,C35,C45,C53,C62,C68,C69,C7,C70,C85
`Chr2:59043667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A18,B102,B110,B124,B128,B16,B6,B8,B88,C22,C49,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794360.1

148 aa

148

SOFL

PF30936 SOFL 6-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794360.1`	Pfam	`PF30936`	SOFL	Family	6	87	1.7e-10	42.2	SOB FIVE-LIKE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938377.1
GTAGCCTAGACAACTGGCAAGTTTGATTCCTACAGAATTAAGGCAAAGGGATAGAGCCAAGCGAAAATATAGTCAAGGGATATGCGAGTTGAGAGTGATTTATTTGGTATCATATAATTCTTCCTCTTCTTTTTTTTTTTTGCTCCCTATCATTATATAAAGACACATCACGTACCTATCTAGCTACCTATATCTTTACAAACTCTCACAAACCAAAGATTAATCCATCCATTGAAGAATGAACAACACATCCACCTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010711
ATGAACAACACATCCACCTCTGAGTGCAGCAGTGGCTGCGAATCCGGGTGGACTACGTACTTGGACCACCTCTCCAACTCCACATATCCGTACACACACCAACCCAAAGGATCAGCCAATGTGCATGATCATGATCATGATGACGACGATCTTTCTATGGTCTCGGATGCCTCATCGGGGCCTCCCCATTTGCACCCCCCTCCGCCTCAACGAAATCAGAAAACTAAAACAAAAGAGACAAAGTTGAAGTCCAAGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794360.1
MNNTSTSECSSGCESGWTTYLDHLSNSTYPYTHQPKGSANVHDHDHDDDDLSMVSDASSGPPHLHPPPPQRNQKTKTKETKLKSKKKQHSLCLDDTASSPFLHFSQGNAVPPENHHSISTAHFEEERMTKMKVGFFKSSGSLLGRKRQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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