当前解析结果
SmilChr02G003741| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003741 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003741 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003741 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 59064441 - 59066787 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131010706 |
|---|---|
| GeneID | 131010706 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010706 |
| 原始查询 | SmilChr02G003741 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010706 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057794353.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057794353.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057794353.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794353.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794353.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:59065306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B49,B69,B86,C17,C40 |
Chr2:59065317 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 22 | A6,A8,B11,B113,B126,B137,B140,B17,B2,B35,B52,B62,B63,B81,B91,C18,C2,C58,C62,C67,C68,D1 |
Chr2:59065362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B45,B91,C29,C75 |
Chr2:59065364 |
GTT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 20 | A11,A18,B101,B108,B127,B128,B2,B54,B57,B58,B91,C24,C41,C49,C54,C57,C61,C77,C85,D11 |
Chr2:59065480 |
TG |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B105,B77,C58 |
Chr2:59065610 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A3,B98 |
Chr2:59065610 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A3,B98 |
Chr2:59065736 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B8,B83 |
Chr2:59065747 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C44 |
Chr2:59065747 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C44 |
Chr2:59065748 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
Chr2:59065749 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。