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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003752`

染色体: Chr02 坐标: 59158229-59162643 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003752`
名称	SmilChr02G003752
描述	uncharacterized SmilChr02G003752
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59158229 - 59162643 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010677`
GeneID	`131010677`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010677`
原始查询	`SmilChr02G003752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845]; symbol=AT5G47940; hit=AT5G47940; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845]; symbol=AT5G47940; hit=AT5G47940; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G47940` (AT5G47940) 40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845] identity=38.5; qcov=0.484; evalue=1.92e-63; confidence=medium
Rice	`Os07g0569000` - identity=30.2; qcov=0.666; evalue=4.1e-48; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010677

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057794318.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057794318.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794318.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057794318.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794318.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59158490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:59158503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B34,C79
`Chr2:59159673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C87,D2
`Chr2:59160712`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	92	A10,A15,A16,A22,A23,A25,A3,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B104,B105,B106,B109,B111,B114,B118,B12,B123,B125,B126,B131,B133,B134,B137,B139,B14,B15,B19,B20,B23,B24,B26,B29,B31,B33,B35,B4,B42,B43,B46,B5,B50,B54,B55,B6,B67,B69,B70,B78,B79,B85,B87,B90,B92,B94,B97,C13,C14,C17,C18,C21,C27,C29,C32,C33,C35,C38,C40,C41,C42,C46,C52,C54,C55,C57,C58,C61,C71,C75,C76,C82,C84,C85,D1,D2,D3,D4,D6
`Chr2:59160756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B98,C45
`Chr2:59160758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C39
`Chr2:59160767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C50
`Chr2:59160782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:59160785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:59160798`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C20,C83,D11
`Chr2:59160798`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C20,C83,D11
`Chr2:59160841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A11,B120,B139,B32,C47,D11

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938335.1
GAAGTCATATTTCATACTTGGCCGTAGGCCGTAGATAATACGCAACGGAACTCAATTGAGACGAAGCTCTCTTACTTTTTATCAGCATACTTTCGTACTTTGAAGTTTAAACCCTAACTCAGAATCGGTAGAGAGAAATGGAACCAGAAGATTGCATTACCAGTAATTGCAGTGAGATTCCACAATGGAGTTATGAAGCCAATTGGATCATCGCTCACGGCTCTCTCGAATCTTCCGTCACCGTTGAGTCCTCTGACGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010677
ATGGAACCAGAAGATTGCATTACCAGTAATTGCAGTGAGATTCCACAATGGAGTTATGAAGCCAATTGGATCATCGCTCACGGCTCTCTCGAATCTTCCGTCACCGTTGAGTCCTCTGACGAGCCGATCGCAGAACCCGACCCAGAAAATACGGCCTCTAAATTGCCACTGATTCTGAAGCCTCGTAGCCCCGATTCTGGCCATTGTGAAATTAAGATATGTTTTAAGCAAAAGTATGAGGTTGGGCAAATATATGTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794318.1
MEPEDCITSNCSEIPQWSYEANWIIAHGSLESSVTVESSDEPIAEPDPENTASKLPLILKPRSPDSGHCEIKICFKQKYEVGQIYVRSTARAYEIYYATSSHSINEYLSTVRCGVAERGDKVLQTCCVEDVAEEHGKSLSGDVTAETASSGGSAATSEDDWVKIKVPGTGSSPASDKTGTNGLNNIQDLYEATAQISDSEPCLSLTIRLLSLQDKGHVYVDEIYVFVDPVESTDSGNGAASAGGLAQSSLMAMFMPTLLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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