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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003778`

染色体: Chr02 坐标: 59468707-59471332 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003778`
名称	SmilChr02G003778
描述	uncharacterized SmilChr02G003778
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59468707 - 59471332 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010726`
GeneID	`131010726`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010726`
原始查询	`SmilChr02G003778`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490]; symbol=AT3G19540; hit=AT3G19540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490]; symbol=AT3G19540; hit=AT3G19540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G19540` (AT3G19540) glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490] identity=64.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0591100` (OJ1174_G05.24) - identity=65.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04788 (DUF620)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010726

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794371.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057794371.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057794371.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057794371.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59468999`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr2:59468999`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B3
`Chr2:59469035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:59469036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B104,C2,C32,C68
`Chr2:59469041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:59469123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:59469137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B72,C53
`Chr2:59469435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B22,C83,D4
`Chr2:59469485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:59469547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr2:59469735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,C20,C21,C38
`Chr2:59469777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B33,B69,C17,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794371.1

453 aa

226

453

DUF620

PF04788 DUF620 166-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794371.1`	Pfam	`PF04788`	DUF620	Domain	166	404	5.7e-117	390.1	Protein of unknown function (DUF620)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938388.1
GGACACTGTATATAAAGAGCGAAACAAAAAAGAAAAATGCTCTGCTTCTTCCAAACGTCATTCTCTCTCCTTTTCCACTTTCTCTCTCCTCCCTTTTGCTAAGTATACATACATTACATACTAGCAGCAGCGGCGCTGTGTAATTCGCCTCGCATTGCTGCCAACATGGAGCGAAAGCAGGGGTTTTTCTCAGCTCTCAAGGAGGAGGTGGTTCGCGGGCTCTCGCCGGCGCGGTCGAGGAGTGGCCGGAGCCAGTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010726
ATGGAGCGAAAGCAGGGGTTTTTCTCAGCTCTCAAGGAGGAGGTGGTTCGCGGGCTCTCGCCGGCGCGGTCGAGGAGTGGCCGGAGCCAGTCGCCGTCCGCTTCGGGCCTGCTCCGTCGGAGGAGAGGCAGCAGCCTGGGCCCGCCAGATATATACATGATGAGATCGGGCAGTTTCAGGCCCGGGGTTGAGGCCCTCTCGCCCTTGAGGGAGGGCCCGGATCCAAGCGGCCCGGATTCTTCCGACCCGAAGAGCGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794371.1
MERKQGFFSALKEEVVRGLSPARSRSGRSQSPSASGLLRRRRGSSLGPPDIYMMRSGSFRPGVEALSPLREGPDPSGPDSSDPKSERWAHWLCRAPSVSTAGSDLRLLLGVLGAPLGPVHVTNNEPLPHLCIKDTPIECSSAQYILQQYLAASGGQKVQSSVQNAYAMGSVKMVTSDIETATKVLKSRNSAESGSFVLWQMNPDMWYVELALGGSKVHAGCNGTLVWRHTPWLGAHAAKGPVRPLRRALQGLDPGTTASM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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