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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003794`

染色体: Chr02 坐标: 59589849-59591916 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003794`
名称	SmilChr02G003794
描述	uncharacterized SmilChr02G003794
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59589849 - 59591916 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010740`
GeneID	`131010740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010740`
原始查询	`SmilChr02G003794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843351]; symbol=AT1G70150; hit=AT1G70150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843351]; symbol=AT1G70150; hit=AT1G70150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G70150` (AT1G70150) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843351] identity=45.5; qcov=1.14; evalue=3.08e-68; confidence=high
Rice	`Os07g0481000` - identity=38.5; qcov=1.15; evalue=3.26e-53; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20179 (MSS51_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794384.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794384.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794384.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794384.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794384.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59591336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr2:59591446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C87,D5
`Chr2:59591632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B44,B91
`Chr2:59591632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B91
`Chr2:59591674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B91
`Chr2:59591675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B91
`Chr2:59591716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B140,B68,C62
`Chr2:59591716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B68,C62
`Chr2:59591756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B20,C84
`Chr2:59591769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C43
`Chr2:59591772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C28
`Chr2:59591780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A1,B110,B112,B113,B13,B140,B19,B2,B20,B28,B31,B42,B86,B90,C2,C3,C32,C48,C69,C84,C87,D4,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794384.1

224 aa

112

224

MSS51_C

PF20179 MSS51_C 78-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794384.1`	Pfam	`PF20179`	MSS51_C	Domain	78	224	1.7e-17	64.5	MSS51 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096647.1
TTCACAACTCAACTATCGGCTCGGCTTCACGCTGAATATCAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAAAACTGCATCGGTTGGAAAAATTGAAAAGCTTCTGATAAATATCCTCCCTCTATTCTCACATTCAAAATTTGCGTTCTTCCCACAGCCACAATTCTTTTCAACATCAGATTTCTTAATTTTTCACTGCTCCTCTTATTCACGCAGTTCATCCCTTCCGATGAACGCCAAATGCTCGACGAAAATTCTGTTAGAG...

XM_057938401.1
GATATATTCACAACTCAACTATCGGCTCGGCTTCACGCTGAATATCAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAAAACTGCATCGGTTGGAAAAATTGAAAAGCTTCTGATAAATATCCTCCCTCTATTCTCACATTCAAAATTTGCGTTCTTCCCACAGCCACAATTCTTTTCAACATCAGATTTCTTAATTTTTCACTGCTCCTCTTATTCACGCAGTTCATCCCTTCCGATGAACGCCAAATGCTCGACGAAAATTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010740
ATGAAGCGCGCTGACATCTTGAATGATTTCCCTTTCATATTCACGCGAGAAGCTATCCAAATCCAGGGTACAAGGTGTTCATTTTCAAAAAGGCACGGCATCCACCTTTCAGGAATGTGGATTTGTGAATGCAGCTGCGTAGGAGTCTCAGCTTCTAATTTCGAACTTTTGAGGTTGAACAGTAATTCGAATCTTCCAAGTGAGGCTTTGGCTGCTTTGCTTCTTCATTGGCCCTTAACAATATTTCGGGCCATTCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794384.1
MKRADILNDFPFIFTREAIQIQGTRCSFSKRHGIHLSGMWICECSCVGVSASNFELLRLNSNSNLPSEALAALLLHWPLTIFRAIQLATLESLLPEFSNELRIHYLGPERELLQLAVFGELQALFPGVNVYIDLFAPAIPQVRDGEKIDLYTYSQCNNMDCGCRSSAVSYRERIDTCHSSAITLRLHAGFYHHCCRELQQDCFPHIIIAANAGVAAYISWLPTI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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