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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003801`

染色体: Chr02 坐标: 59636699-59638951 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003801`
名称	SmilChr02G003801
描述	uncharacterized SmilChr02G003801
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59636699 - 59638951 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010745`
GeneID	`131010745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010745`
原始查询	`SmilChr02G003801`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835922]; symbol=AT5G58100; hit=AT5G58100; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835922]; symbol=AT5G58100; hit=AT5G58100; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G58100` (AT5G58100) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835922] identity=72.7; qcov=0.965; evalue=1.86e-50; confidence=medium
Rice	`Os06g0584200` (P0498C03.39-2) - identity=50; qcov=0.333; evalue=2.85e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25483 (DUF7906)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057794391.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794391.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057794391.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057794391.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794391.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59636940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B41,D3
`Chr2:59636979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B49,B67,B71,C65
`Chr2:59637342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A1,A10,B102,B106,B108,B110,B127,B135,B18,B31,B32,B34,B4,B58,B9,B93,B94,C16,C19,C29,C45,C50,C6,C60,C69,C8,C80,D2
`Chr2:59637344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C9
`Chr2:59637380`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr2:59637380`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr2:59637514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B100,B48,B75,C48
`Chr2:59637557`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B131,B89
`Chr2:59637557`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B131,B89
`Chr2:59637808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:59637813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794391.1

114 aa

114

DUF7906

PF25483 DUF7906 34-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794391.1`	Pfam	`PF25483`	DUF7906	Domain	34	83	1.9e-11	45.0	Domain of unknown function (DUF7906)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938408.1
CGTCCGTTGCTAAATAGCAACGGAATTTTCCGTTGCTATTCCGTTGCTGTGCCCTAAAAAAAAGGTGAATGAACCGCGCCTCCTCCTTCATTTTTTCAACACAACTTTCACTTCTATTTCTCAAAATTCCCAAATTTCCCCCCTCCGATTCCCCATTTCCGGCGACTCCCGCTGCGTGCTCCCCTTCGGCGACTCGTCCACGCCGCCGTTTCCACCGCGCCCCTGCTCGCCCCGCCCTGCGCCGCTCCGCGCCCTGCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010745
ATGATACAGAGCAAAGTTCTGCAGGTTTTGGGAGGGAAAAATGAAAATTTGAAGCTTGTTTCTAAGAAAGATTTAGAGTCTGAAAACTTAAATGGTTTTCATGCTGAATGTCTGACAGATACATGGATTGGAAATCAAAGGTGGGCTTTCATCGACTTGTCTGCTGGACCATTTTCATGGGGACCTTCAGTAGGTGGTGAAGGAGTCCGTACAGCACAAAGCCTACCAAATGTGGAGAAAACAATTGGTGCAGTTGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794391.1
MIQSKVLQVLGGKNENLKLVSKKDLESENLNGFHAECLTDTWIGNQRWAFIDLSAGPFSWGPSVGGEGVRTAQSLPNVEKTIGAVAEISEDEAEDRLQEAIQEKFAVFGEVGIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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