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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003809`

染色体: Chr02 坐标: 59715822-59718320 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003809`
名称	SmilChr02G003809
描述	uncharacterized SmilChr02G003809
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59715822 - 59718320 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010752`
GeneID	`131010752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010752`
原始查询	`SmilChr02G003809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490]; symbol=AT3G19540; hit=AT3G19540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490]; symbol=AT3G19540; hit=AT3G19540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G19540` (AT3G19540) glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit A (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821490] identity=64.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0591100` (OJ1174_G05.24) - identity=65.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04788 (DUF620)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794399.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057794399.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057794399.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057794399.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59716046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr2:59716301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr2:59716484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B103,B72,C53
`Chr2:59716511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B126,B36,B59,C4
`Chr2:59716514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr2:59716543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr2:59716550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B5,C28,C79
`Chr2:59716557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C34,D9
`Chr2:59716559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C14,C47
`Chr2:59716669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C34,D9
`Chr2:59716709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:59716757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794399.1

453 aa

226

453

DUF620

PF04788 DUF620 166-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794399.1`	Pfam	`PF04788`	DUF620	Domain	166	404	5.7e-117	390.1	Protein of unknown function (DUF620)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938416.1
AAGAAAAATGCTCTGCTTCTTCCAAACGTCATTCTCTCTCCTTTTCCACTTTCTCTCTCCTCCCTTTTACATTACATACTAGCAGCAGCGGCGCTGTGTAATTCGCCTCGCATTGCTGCCAACATGGAGCGAAAGCAGGGGTTTTTCTCAGCTCTCAAGGAGGAGGTGGTTCGCGGGCTCTCGCCGGCGCGGTCGAGGAGTGGCCGGAGCCAGTCGCCGTCCGCTTCGGGCCTGCTCCGTCGGAGGAGAGGCAGCAGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010752
ATGGAGCGAAAGCAGGGGTTTTTCTCAGCTCTCAAGGAGGAGGTGGTTCGCGGGCTCTCGCCGGCGCGGTCGAGGAGTGGCCGGAGCCAGTCGCCGTCCGCTTCGGGCCTGCTCCGTCGGAGGAGAGGCAGCAGCCTGGGCCCGCCAGATATATACATGATGAGATCGGGCAGTTTCAGGCCCGGGGTTGAGGCCCTCTCGCCGTTGAGGGAGGGCCCGGATCCAAGCGGCCCGGATTCTTCCGACCCGAAGAGCGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794399.1
MERKQGFFSALKEEVVRGLSPARSRSGRSQSPSASGLLRRRRGSSLGPPDIYMMRSGSFRPGVEALSPLREGPDPSGPDSSDPKSERWAHWLCRAPSVSTAGSDLRLLLGVLGAPLGPVHVTNNEPLPHLCIKDTPIECSSAQYILQQYLAASGGQKVQSSVQNAYAMGSVKMVTSDIETATKVLKSRNSAESGSFVLWQMNPDMWYVELALGGSKVHAGCNGTLVWRHTPWLGAHAAKGPVRPLRRALQGLDPGTTASM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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