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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003813`

染色体: Chr02 坐标: 59753881-59755935 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003813`
名称	SmilChr02G003813
描述	metal transporter Nramp3.1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59753881 - 59755935 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010756`
GeneID	`131010756`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010756`
原始查询	`SmilChr02G003813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metal transporter Nramp3.1-like
产物	metal transporter Nramp3.1-like
Arabidopsis	`AT1G47240` (NRAMP2) NRAMP metal ion transporter 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841127] identity=71.5; qcov=0.872; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0581600` (OsNRAMP7) - identity=67.3; qcov=0.85; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0015086 (cadmium ion transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0030001 (metal ion transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01566 (Nramp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010756

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057794403.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057794403.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794403.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794403.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59754015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:59754527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B27,C29
`Chr2:59754903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C18,C39,D8
`Chr2:59755101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:59755394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C18,C39,D8
`Chr2:59755406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B122,B71,C62
`Chr2:59755750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794403.1

540 aa

270

540

Nramp

PF01566 Nramp 92-490 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794403.1`	Pfam	`PF01566`	Nramp	Domain	92	490	4.9e-119	398.5	Natural resistance-associated macrophage protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938420.1
TATATCGTCAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAGCAACCTCATCTTTCACGGTCAACGCAAAATTGGTCGAAAAAATAACAAACACATGCAAATTAATAATCTGATTCTCATAAATCCGATGACCTCTTCTCCCAACAGTCCCACTTCATTCTCTCCCCGCCACCACCACAACCACCACCACCGCCATGCCGACTCCAATCCCCTCCTCCCCTCGTCCGCCGCGCCGCTACCGATCCCGCCCCACGTCGCCCACGAATCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010756
ATGCAAATTAATAATCTGATTCTCATAAATCCGATGACCTCTTCTCCCAACAGTCCCACTTCATTCTCTCCCCGCCACCACCACAACCACCACCACCGCCATGCCGACTCCAATCCCCTCCTCCCCTCGTCCGCCGCGCCGCTACCGATCCCGCCCCACGTCGCCCACGAATCAAGCATTCTCCTCCACAGCGTGGAGATCGAGAGCAGCGACTCCCCCGGCGTGGCGGTGCCGCCGTTCTCGTGGAAGAAGCTCTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794403.1
MQINNLILINPMTSSPNSPTSFSPRHHHNHHHRHADSNPLLPSSAAPLPIPPHVAHESSILLHSVEIESSDSPGVAVPPFSWKKLWKFTGPGFLMSVAFLDPGNLEGDLQSGAIAGYSLLWLLLWATLMGLLIQLLALRLGVATGRHLAEICRQEYPFWAGLMLWFMAELALIAADIQEVIGSAIAIKILSNGFFPLWAGVIITASDCFIFLFLENYGIRKLEAFFGVLITSMAISFAWMFVDAKPGGKELLDGILVPRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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