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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003834`

染色体: Chr02 坐标: 60029734-60031099 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003834`
名称	SmilChr02G003834
描述	probable carbohydrate esterase At4g34215
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60029734 - 60031099 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010778`
GeneID	`131010778`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010778`
原始查询	`SmilChr02G003834`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carbohydrate esterase At4g34215
产物	probable carbohydrate esterase At4g34215
Arabidopsis	`AT3G53010` (AT3G53010) carbohydrate esterase, putative (DUF303) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824467] identity=61.2; qcov=0.832; evalue=4.33e-105; confidence=high
Rice	`Os03g0857500` - identity=56; qcov=0.804; evalue=2.39e-82; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03629 (SASA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010778

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057794422.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057794422.1`
3	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057794422.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057794422.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794422.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60030091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C18,C39
`Chr2:60030182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:60030390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:60030560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr2:60030564`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B129
`Chr2:60030564`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B129
`Chr2:60030718`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A19,A25,B108,B113,B138,B140,B15,B19,B2,B21,B22,B23,B31,B45,B48,B50,B63,B83,B89,C1,C18,C19,C2,C23,C24,C32,C35,C4,C41,C56,C68,C71,C76,C81,D4
`Chr2:60030749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr2:60030771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:60030830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr2:60030889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:60030943`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A19,A22,B108,B113,B138,B140,B15,B19,B2,B21,B22,B31,B45,B48,B50,B63,B83,B89,C1,C18,C19,C2,C23,C24,C31,C32,C35,C4,C41,C56,C68,C71,C76,C81,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794422.1

291 aa

146

291

SASA

PF03629 SASA 28-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794422.1`	Pfam	`PF03629`	SASA	Domain	28	261	7.2e-88	294.8	Carbohydrate esterase, sialic acid-specific acetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938439.1
AAAGCCATGTTACCTATGACAAATCACAAGTCTTAGTTAATTACTAAATTATATATCCTGTACCTCATCTCAAACCATACTCTATTAATTTGCTACTAAAATAAGGGGAATTTACGAAAAAGATTCTGCAAACAGACACAGCCCAAAAGTGGCTGCCCTGTTCCACAATTGTGACGAGTAAGGAAAAATGTTCCTTCCCTTGAAAACATTCTTACAATAAGTGCCTCTGTTTTCTTGCATTTGCCGCGGCGCCATGTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010778
ATGTTTCTCCTCATTTGCATCATAATTTCAGCCTTCTTCAATTTGCCGAGCGCCGCCGCCGGCAATGCCGCCGCCCAGCCCAAGAGCATATTCATCCTCGCGGGGCAGAGCAACATGTCCGGCCGCGGCGGCGTCGTCAATGACACGTGGGACGGCGTCGTGCCGCCCCAGTGCAGCCCCGACCCGATGATCCTCCGCCTCAGCGCCGCCGCCGAGTGGGAGGAGGCGCGCGAGCCCCTCCACCGGGACATCGACGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794422.1
MFLLICIIISAFFNLPSAAAGNAAAQPKSIFILAGQSNMSGRGGVVNDTWDGVVPPQCSPDPMILRLSAAAEWEEAREPLHRDIDVEKTCGVGPGMPFAHLARRRDPGIGVIGLVPCAIGGTNISEWRRGGRLYRQLMARAQAAVHGGGGLIRGLLWYQGESDTTNHEDARLYKRRLLRFFNDLRSDLLSPVLPVIQVALASGSGPYVDVIRKAQLELELELELPNLRCVDARGLQLEPDGLHLSTRAQVRLGHMLADAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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