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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003853`

染色体: Chr02 坐标: 60298047-60299571 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003853`
名称	SmilChr02G003853
描述	uncharacterized protein At4g06744-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60298047 - 60299571 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010796`
GeneID	`131010796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010796`
原始查询	`SmilChr02G003853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826147]; symbol=AT4G06744; hit=AT4G06744; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826147]; symbol=AT4G06744; hit=AT4G06744; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G06744` (AT4G06744) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826147] identity=57.3; qcov=0.906; evalue=6.37e-152; confidence=high
Rice	`Os04g0505200` - identity=51.4; qcov=0.857; evalue=4.42e-118; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057794439.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057794439.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794439.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794439.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794439.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60298253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B15,B28,B76,D9
`Chr2:60298338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B47
`Chr2:60298338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr2:60298412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:60298440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B15,B28,B76,D9
`Chr2:60298633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:60298698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:60298837`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B135
`Chr2:60298837`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B135
`Chr2:60298838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:60298843`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B135
`Chr2:60298843`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794439.1

406 aa

203

406

LRR_1

PF00560 LRR_1 153-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794439.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	153	170	1.1e-15	55.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938456.1
TTATCAACAGAAATTACACTTAATTTAAAGTGTCTAATCTGCATCAACCAATCCCTTCCCACCAACCAAGCAAATTGAATCGCCAATTAAAGAAACCAAACACACACACCCACACCCACACCCACACTTCTCCACTCTCAACTTAAAAGACTATAAAAAAGTAGTACTTGATTCATACATCATATCCACATTGTTCCAAGCTGCATATTAATTCAAAATGCACCCTACAAAAACCGCCATCAAAATTCAGATTATCATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010796
ATGCACCCTACAAAAACCGCCATCAAAATTCAGATTATCATCGCCGCAATCCTACTAGGCGTAGCCCGTCACGGCGAAACACACGGGTTAACATTCCCGTCTGCTCCGCCTTTGGGCCCCACACCATCGGAGGCCGACCTGATTTTCACTGACCAGAGGCTAGCCGCCGTATTCCCAATCATCCAGAATTTCAAGAGCCTCATCACCTCCGATCCCTTCAACGTCACCGCCACGTGGGCCGGGCCCGATGTGTGCGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794439.1
MHPTKTAIKIQIIIAAILLGVARHGETHGLTFPSAPPLGPTPSEADLIFTDQRLAAVFPIIQNFKSLITSDPFNVTATWAGPDVCAYKGFYCESPPDNRSATALASIDFNGFRLAAPTLAGFLDRLPDLALFHANSNDFGGAIPPGTAALPYLYELDVSNNRLSGPFPAAVVGMAGLAFLDLRFNALSGAVPPQLFGRRGLDALFINNNLFATRLPDNLGATHIVYLTLANNRFFGPIPRSISRTFSNVSEILLLNNLLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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