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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003854`

染色体: Chr02 坐标: 60301658-60305107 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003854`
名称	SmilChr02G003854
描述	uncharacterized SmilChr02G003854
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60301658 - 60305107 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010798`
GeneID	`131010798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010798`
原始查询	`SmilChr02G003854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834834]; symbol=AT5G47830; hit=AT5G47830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834834]; symbol=AT5G47830; hit=AT5G47830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G47830` (AT5G47830) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834834] identity=55.4; qcov=0.841; evalue=2.56e-56; confidence=high
Rice	`Os02g0158600` - identity=49.3; qcov=0.83; evalue=4.41e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25017 (zf-C2HC_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794442.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794442.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057794442.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057794442.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794442.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60301920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:60304581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C75
`Chr2:60304610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr2:60304662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B132,B2,C60,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794442.1

176 aa

176

zf-C2HC_3

PF25017 zf-C2HC_3 129-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794442.1`	Pfam	`PF25017`	zf-C2HC_3	Domain	129	173	5.1e-26	91.1	C2HC zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938459.1
GAATTCGAGCAGAATTTGCTGGAAACATCTGGTTTCAATTCATTGCAAATATATTTGCCCAAAATAAAATAAGAAATCATTGTGAAACGGTAAAGGTGTAATCGAGAAACTGAACTGTAATGCCATGAGCGGTGGCGACGCCGACATGATGGAAGCGGAGGCCTCGGCTCCGCCGTCTGCTCCGCCGCGTGAGGTCGGCCCCGCTTCTGACCCTAACGATATCAGGAATTTGCTGACGATGGCTCGCAAGCTCATTAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010798
ATGAGCGGTGGCGACGCCGACATGATGGAAGCGGAGGCCTCGGCTCCGCCGTCTGCTCCGCCGCGTGAGGTCGGCCCCGCTTCTGACCCTAACGATATCAGGAATTTGCTGACGATGGCTCGCAAGCTCATTAATCAAGGGAAGCCTTCCCAGGCACTCGAAGTGGTGATAATGGCAATGAAAATACAAGGTGGAGACGTAGCTGTATCTCAAGGTCTAAGTCGTGCTCAAGAACTATACAGGAATAAAATTCAAGCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794442.1
MSGGDADMMEAEASAPPSAPPREVGPASDPNDIRNLLTMARKLINQGKPSQALEVVIMAMKIQGGDVAVSQGLSRAQELYRNKIQASSAADELASLFAECAIAEAIPLQPETSQHKISEEPIEPDPQERSILAETGRKQVMLDAFSDGSSFVCLQCGGLVSNLRREEHYAFWCYKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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