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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003856`

染色体: Chr02 坐标: 60366203-60366763 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003856`
名称	SmilChr02G003856
描述	(S)-coclaurine N-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60366203 - 60366763 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009827`
GeneID	`131009827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009827`
原始查询	`SmilChr02G003856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(S)-coclaurine N-methyltransferase-like
产物	(S)-coclaurine N-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT4G33110` (AT4G33110) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829448] identity=64.8; qcov=0.939; evalue=1.07e-49; confidence=medium
Rice	`Os07g0474600` - identity=31.6; qcov=0.687; evalue=5.44e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02353 (CMAS); PF13649 (Methyltransf_25)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793216.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057793216.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793216.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793216.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60366286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B3,B32,C23
`Chr2:60366298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:60366617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B18,B30
`Chr2:60366630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A19,B72,B97,C40
`Chr2:60366748`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B44,B74,C37,C64,C69,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793216.1

115 aa

115

CMAS

Methyltransf_25

PF02353 CMAS 11-107 aa PF13649 Methyltransf_25 67-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793216.1`	Pfam	`PF02353`	CMAS	Family	11	107	6.3e-23	82.2	Mycolic acid cyclopropane synthetase
`XP_057793216.1`	Pfam	`PF13649`	Methyltransf_25	Domain	67	107	3.3e-06	28.4	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937233.1
ATGCCGATAGCAATCAAGACAGAAGAGCCCAAGTATCAACATTATGAAGTTCCAACCTCTTTCTTCAAGCTCGTTCTTGGGAAGCATCTAAAATACAGTTGCTGCTTCTTCCTAGACAAGTCGAGCACATTAGAGGATGCTGAGAAGGCAATGCTGGAGCTATACTGCGAGAGGTCGCAGATGAAAGACAACTATTCTGTTCTTGACGTCGGCTGTGGCTGGGGATCGCTTTCTCTGTATTTAGCACAAAAGTACCCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009827
ATGCCGATAGCAATCAAGACAGAAGAGCCCAAGTATCAACATTATGAAGTTCCAACCTCTTTCTTCAAGCTCGTTCTTGGGAAGCATCTAAAATACAGTTGCTGCTTCTTCCTAGACAAGTCGAGCACATTAGAGGATGCTGAGAAGGCAATGCTGGAGCTATACTGCGAGAGGTCGCAGATGAAAGACAACTATTCTGTTCTTGACGTCGGCTGTGGCTGGGGATCGCTTTCTCTGTATTTAGCACAAAAGTACCCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793216.1
MPIAIKTEEPKYQHYEVPTSFFKLVLGKHLKYSCCFFLDKSSTLEDAEKAMLELYCERSQMKDNYSVLDVGCGWGSLSLYLAQKYPNSQIIGICNSTTQKSHIEEQCRYMLFFFV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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