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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003857`

染色体: Chr02 坐标: 60367588-60369177 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003857`
名称	SmilChr02G003857
描述	SUMO-conjugating enzyme SCE1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60367588 - 60369177 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010800`
GeneID	`131010800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010800`
原始查询	`SmilChr02G003857`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SUMO-conjugating enzyme SCE1-like
产物	SUMO-conjugating enzyme SCE1-like
Arabidopsis	`AT3G57870` (SCE1) sumo conjugation enzyme 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824956] identity=78.1; qcov=1; evalue=7.75e-97; confidence=high
Rice	`Os03g0123100` (OsSce2) - identity=81.5; qcov=0.981; evalue=1.04e-99; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0061656 (SUMO conjugating enzyme activity)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794444.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794444.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794444.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057794444.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794444.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60367771`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B125,B15,B76,B99,C62,D9
`Chr2:60367944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B32
`Chr2:60368510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B15,B76,B99,D9
`Chr2:60368581`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	C75,D1
`Chr2:60368581`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C75,D1
`Chr2:60368609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C17
`Chr2:60368986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794444.1

160 aa

160

UQ_con

PF00179 UQ_con 9-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794444.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	9	152	1.1e-45	155.4	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938461.1
GGGTAATTGAGAAGTCAAGTGTATCTTGACTCCTTTCCAATATATAGTACTACTAAATTTGAAGCCCTTTCCCGTGATAATTTGAAAAAATCAGTGTAAAAGAAATCAAAGCAGAAGTTGGAAGCAAGCAATAGAGAATGTCAGTGGGCATATCGCAAGCTCGCCTCGCCGAGGAGCGCAAGGCATGGCGCAAGAATCACCCATACGGTTTTGTGGCGCGACCTGAGACTACTTCGGATGGTTCGGTCAATTTGATGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010800
ATGTCAGTGGGCATATCGCAAGCTCGCCTCGCCGAGGAGCGCAAGGCATGGCGCAAGAATCACCCATACGGTTTTGTGGCGCGACCTGAGACTACTTCGGATGGTTCGGTCAATTTGATGGTGTGGCATTGCCTCATCCCTGGTAAATCAAACACGGAGTGGGAGGGCGGCTACTATCCTCTCACGATGCATTTTAGCGAAGACTATCCTAGCAAACCACCCAAGTGCAAGTTCCCTCCGAATTTCTTCCACCCTAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794444.1
MSVGISQARLAEERKAWRKNHPYGFVARPETTSDGSVNLMVWHCLIPGKSNTEWEGGYYPLTMHFSEDYPSKPPKCKFPPNFFHPNIYPSGTVCLSILSEDSGWRPAITVKQILVGIQDLLDQPNASDPAQTDGYQLFTQQPEEYKKRVRQQAKKYPSPV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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